APP下载

宏基因组测序技术检测血流感染样本去宿主干扰效应四种预处理方法的比较

2023-08-07贾适瑜王飞燕杨琳梅中国医学科学院阜外医院实验诊断中心北京00037云南省阜外心血管病医院检验科昆明6500

现代检验医学杂志 2023年4期
关键词:血浆检测方法

贾适瑜,王飞燕,杨琳梅,耿 洁,李 峰,高 简,周 洲,程 军(.中国医学科学院阜外医院实验诊断中心,北京 00037;.云南省阜外心血管病医院检验科,昆明 6500)

血流感染(blood stream infection,BSI)是指各种病原微生物侵入血流而引起的一种严重全身感染性疾病[1]。随着侵入性操作、广谱抗生素及免疫抑制剂等的广泛应用,血流感染的发生率呈逐年上升趋势[2]。血流感染的早期诊断对缩短住院时长、减少治疗费用、降低病死率有重要意义。目前,其诊断主要依赖于传统培养方法,但存在报告时间长、苛养菌培养困难等缺点[3-4]。分子生物学检测具有高灵敏度、高特异度及报告时间短等优点,已成为难培养病原微生物检测的重要手段。但多数分子生物学方法只能检测某些特定类型的病原微生物[5-6],无法满足临床对疑难重症感染的诊断需求。宏基因组测序(metagenomic next generation sequencing,mNGS)技术则可在感染早期不受靶标限制从样本中直接检测包括细菌、病毒、真菌和寄生虫在内的所有病原微生物[7]。然而,血流感染患者初始病原微生物浓度在1~103CFU/ml 之间[8-9],大量宿主核酸限制了血液中病原微生物的检测,如何降低宿主核酸对病原微生物的影响,成为mNGS 亟需解决的问题。因此,建立高效、标准化的病原微生物核酸分离方法对于血流感染的早期诊断至关重要。本研究通过mNGS 检测预处理后的模拟血流感染样本,旨在评估Saponin 法、Wash 法、CD45 法和MolYsis 法四种预处理方法的去宿主效率[10-13]。

1 材料与方法

1.1 研究对象 选择金黄色葡萄球菌ATCC25923标准菌株模拟血流感染样本,来自无感染患者的全血混合样本作为基质和阴性对照。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

血浆检测方法
糖尿病早期认知功能障碍与血浆P-tau217相关性研究进展
血浆置换加双重血浆分子吸附对自身免疫性肝炎合并肝衰竭的细胞因子的影响
CHF患者血浆NT-proBNP、UA和hs-CRP的变化及其临床意义
小波变换在PCB缺陷检测中的应用
用对方法才能瘦
四大方法 教你不再“坐以待病”!
脑卒中后中枢性疼痛相关血浆氨基酸筛选
捕鱼