文︱国家蚕桑产业技术体系首席科学家、中国品牌建设丝绸桑蚕品牌集群领导小组副组长 代方银

我是西南大学的代方银，借论坛平台简要汇报一项新的科研成果——“家蚕种质资源基因组数字化”。

家蚕是重要的经济动物。养蚕业发祥于我国，具有悠久历史和灿烂文化，至今我国蚕丝产量占全世界的75%以上。目前我国家蚕遗传资源研究位于世界领先地位，建有世界最大的家蚕基因库，保存资源1000 余系，这是几代人长期坚持开展家蚕基因研究取得的成果。

在家蚕单一参考基因组研究方面，此前已有基因组框架图、整合图、高质量参考基因组，这些都是对同一个品系的研究。在蚕的群体基因组方面，一是2009 年发表的40 个基因组重测序，二是2018 年发表的137个品系重测序结果。

然而，单一品系的参考基因组和少量品系的重测序，不足以发现家蚕丰富的遗传变异，对性状解析、品种研究的支撑有限。于是，我们在2018年提出了“千蚕基因组计划”，利用新的三代测序技术与二代重测序结合，解析大量资源的基因组。我们共收集、提取了47 份野桑蚕、1031 份家蚕材料的基因组，覆盖了中国、日本、欧洲、热带等家蚕几大地理系统和野桑蚕，代表了最丰富的多样性。

主要结果一：构建了基于1082 个资源深度二代测序的系统发生树，支持家蚕驯化起源于黄河中下游地区。

主要结果二：选取各类代表性品系545 个进行了三代（长度长）测序，平均测序深度97 倍，完成了这些基因组的高质量组装。……