猪链球菌(Streptococcussuis)是一种对人兽健康有严重危害的革兰氏阳性病原菌，可造成猪和人患上败血症、脑膜炎等病，对畜牧养殖业和人的健康造成很大的威胁[1]。我国于1998年和2005年发生两起人感染猪链球菌聚集性疫情，造成多人死亡，近年来常有零星病例报告，需要引起重视[2-4]。猪链球菌根据荚膜多糖抗原的不同分为33个血清型，包括1/2、1-31、33型[5-7]，2型是迄今为止从猪和人类病例中分离出的最常见的血清型[8-9]。然而，在许多欧洲国家，9型已经成为引起猪侵袭性疾病的重要且流行的血清型，这种血清型经常从密集饲养的猪群的患病猪分离出来，流行病学研究表明，近年来，我国9型的流行率不断上升[9-11]。并且已有从野猪、野猫中分离出来的报道[13-14]。近年来也有猪链球菌9型引起的人类病例的报道[15]，说明这种血清型具有人兽共患特性，这应该引起我们重视。

基因组技术的使用使得猪链球菌发病机理的研究有了质的飞跃，以往研究表明猪链球菌种群的基因组存在很大差异，即使是同一血清型的菌株之间基因型也可能不同，同时毒力因子也存在差异，存在较大地理差异[16-17]，意味着毒力潜力是遗传相关的。尽管9型流行率越来越高，但是关于9型菌株的数据很少，有少量的研究报道称并非所有9型菌株都具有相同的毒力潜力[18-19]，加大对9型猪链球菌的分子水平研究十分必要。本研究测定分离自广东某猪9型猪链球菌强毒株的全基因组序列，将测序得到的结果与NBCI上的基因组数据库上的数据进行对比分析，获得全基因组序列注释信息并与NCBI中得到近缘菌株进行比较分析。……