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脑胶质瘤干细胞衍生的外泌体lncRNA HOXAAS2促进脑胶质瘤的增殖、迁移、侵袭和干细胞特性

2022-02-16廖星合刘占涛刘明辉

中国癌症杂志 2022年12期
关键词:货号外泌体胶质瘤

廖星合,刘占涛,刘明辉

1.复旦大学附属肿瘤医院综合治疗科,复旦大学上海医学院肿瘤学系,上海 200032;

2.广东省人民医院赣州医院(赣州市立医院)神经外科,江西 赣州 341000

脑胶质瘤是原发性脑瘤中发病率最高的肿瘤,因其独特的生物学特性[1-2]导致患者治疗难度大、致残和致死率高及预后差[3-4]。因此,探索新的诊断标志物和治疗方法显得极其重要和紧 迫。

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在脑胶质瘤的发生和发展过程中发挥着重要作用[5-6]。目前已经发现HOXA集群反义RNA2(HOXA-AS2)与胶质瘤相关[7-8]。然而HOXA-AS2调节胶质瘤细胞增殖的机制仍不清楚。肿瘤干细胞样细胞(cancer stem-like cell,CSC)具有自我更新和形成大块肿瘤的能力[9-10]。CSC与非CSC可以互相转化[11],既往研究已经发现lncRNA参与了这一过程[12]。然而目前HOXA-AS2与胶质瘤干细胞(glioma stem cell,GSC)的关系尚未确定。外泌体可以通过传递细胞内的物质(包括蛋白质、DNA、miRNA、lncRNA和mRNA)来介导细胞间的相互作用[13]。此外,肿瘤源性外泌体与肿瘤发生及肿瘤微环境有关[14]。然而,含有HOXA-AS2的GSC来源外泌体是否对胶质瘤细胞增殖、迁移和干细胞特性有影响尚不清楚。因此,本研究对上述问题进行探究。

1 材料和方法

1.1 细胞培养和实验试剂

人皮质星形胶质细胞系HA1800、人胶质瘤细胞系T98G、SHG44、U251MG和HEK-293T细胞均购自中国科学院典型培养物保藏委员会细胞库。胎牛血清(fetal bovine serum,FBS)、DMEM培养基、TRIzol®试剂、免疫磁珠分选试剂盒、RIPA缓冲液、ECL检测试剂、死亡细胞凋亡试剂盒、Step-One Plus实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)系统均购自美国Thermo Fisher Scientific公司。EntiLinkTM第1链cDNA试剂盒、EnTurboTMSYBRGreen PCR SuperMix系统购自武汉科鹿生物科技有限公司。FACS Calibur流式细胞仪购自美国BD公司。CD133兔单抗(1∶1 000)、SOX2兔单抗(1∶1 000)、OCT4兔单抗(1∶1 000)、cleaved caspase 3兔单抗(1∶1 000),CD9兔单抗(1∶1 000)、CD63兔单抗(1∶1 000)、CD81兔单抗(1∶1 000)、TSG101兔单抗(1∶1 000)和β-actin小鼠单抗(1∶1 000)等所有一抗和相应二抗均购自英国Abcam公司。PKH26细胞膜染料、transwell小室购自美国Merck公司。pLVX-IRES-PURO HOXA-AS2慢病毒质粒和含靶向HOXA-AS2质粒购自美国克隆泰克实验室。细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)购自上海碧云天生物技术研究所。Cell-Light EdU Apollo567体外试剂盒购自广州锐博生物科技有限公司。

1.2 临床数据获取

从中国脑胶质瘤基因组图谱(the Chinese Glioma Genome Altas,CGGA; http://www.cgga.org.cn)和癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA; https://portal.gdc.cancer.gov/)数据库下载了包含低级别脑胶质瘤(low-grade glioma,LGG)和高级别脑胶质瘤(high-grade glioma,HGG)lncRNA的表达数据。本研究从CGGA数据库中选取312例患者信息,从TCGA数据库中选取975例患者信息,包括性别、年龄、生存时间及lncRNA表达情况等。

1.3 方法

1.3.1 识别差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DelncRNA)

从CGGA和TCGA数据库下载了包含LGG和HGG lncRNA表达数据的数据集。用R语言识别LGG和HGG组织之间的DelncRNA。调整后P<0.05和|log2(差异倍数)|>2的lncRNA认定为DelncRNA。使用维恩图包对来自两个数据集(CGGA和TCGA)的重叠DelncRNA进行了识别。此外,我们通过CGGA和TCGA数据集来确定HOXA-AS2水平与胶质瘤患者总生存期(overall survival,OS)之间的关系。

1.3.2 细胞培养

人皮质星形胶质细胞系HA1800,人胶质瘤细胞系T98G、SHG44、U251MG和HEK-293T细胞在含10%FBS的DMEM培养基中培养,细胞均在37 ℃、CO2体积分数为5%的培养箱中培养。

1.3.3 RTFQ-PCR检测

使用TRIzol®试剂分离出总RNA,再使用EntiLink™第1链cDNA试剂盒合成cDNA,然后使用EnTurbo™SYBR-Green PCR SuperMix和Step-One Plus RTFQ-PCR系统进行RTFQPCR。温度条件如下:在95 ℃预温育3 min,然后在95 ℃温育10 s,58 ℃温育30 s,72 ℃温育30 s,循环40次。以β-actin作为lncRNA HOXAAS2的内参照物。使用标准2-ΔΔCq方法计算表达水平。引物序列如下:β-actin有义链为5’-GTCCACCGCAAATGCTTCTA-3’,反义链为5’-TGCTGTCACCTTCACCGTTC-3’;HOXA - AS2有义链为5 ’ -GGAAGGACACGTTTCTATGCC-3’,反义链为5’-ACTTGGATTCTGACGGCTCAC-3’。

1.3.4 流式细胞术筛选GSC

在本研究中,我们使用FACS Calibur流式细胞仪和之前描述的免疫磁珠分选试剂盒分选CD133+细胞。SHG44细胞在DMEM/F12培养基[包括碱性成纤维细胞生长因子(basic fibroblast growth factor,bFGF)和表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)]中培养,在37 ℃、CO2体积分数为5%的培养箱中培养。细胞与CD133抗体珠复合物一起温育,之后再加入分选液重新悬浮细胞,洗脱CD133+细胞,随后将分离的CD133+细胞加入CD133-PE抗体,用流式细胞仪进行分选。

1.3.5 蛋白质印迹法(Western blot)检测

利用RIPA缓冲液裂解细胞以获得蛋白质,用二辛可宁酸(bicinchoninic acid,BCA)法测定蛋白质浓度,蛋白质(30 μg/lane)用10%十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecylsulphate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)凝胶分离,转移到PVDF膜(美国Millipore公司)上,然后用5%脱脂牛奶在含有吐温-20三乙醇胺缓冲盐溶液(trisbuffered saline Tween,TBST)中堵塞膜。随后将膜与一抗在4 ℃下温育过夜,然后与相应的二抗(1∶5 000)在室温下温育。ECL检测试剂用于检测蛋白带。所用的一抗如下:CD133兔单抗(1∶1 000,货号397903,Biolegend),SOX2兔单抗(1∶1 000,货号ab92494)、OCT4兔单抗(1∶1 000,货号ab19857)、TSG101兔单抗(1∶1 000,货号ab125011)购自英国Abcam公司,cleaved caspase 3兔单抗(1∶1 000,货号AF7022)、CD63兔单抗(1∶1 000,货号AF5117)购自美国Affbiotech公司,CD9兔单抗(1∶1 000,货号20597-1-AP)、CD81兔单抗(1∶1 000,货号27855-1-AP)购自美国Proteintech公司,β-actin兔单抗(1∶1 000,货号TDY051)购自天德悦(北京)生物科技有限责任公司。以β-actin作为对照。

1.3.6 外泌体的分离和表征

从GSC 中收集上清液,使用超离心法分离外泌体,用BCA 法测定外泌体蛋白浓度,外泌体的识别使用纳米粒子跟踪分析(nanoparticle tracking analysis,NTA)和透射电镜(transmission electron microscope,TEM)测 定。

1.3.7 外泌体摄取

从GSC中提取的外泌体(20 μg)用PKH26细胞膜染料进行荧光标记,胶质瘤细胞与荧光标记的外泌体共培养48 h,使用荧光显微镜观察胶质瘤细胞外泌体的内化情况。

1.3.8 共培养系统

用Cy3标记的HOXA-AS2转染SHG44-GSC,转染的SHG44-GSC接种于transwell®聚酯透性支架上,SHG44细胞接种于下层腔室,温育24 h后,用共聚焦显微镜对SHG44细胞成像。

1.3.9 慢病毒转染

获取pLVX-IRES-PURO HOXA-AS2慢病毒质粒和含靶向HOXA-AS2质粒的慢病毒shRNA后,用慢病毒质粒和包装质粒(pLP/VSVG、pLP1和pLP2)转染HEK-293T细胞72 h,然后收集含病毒的上清液,将适量的慢病毒转导至细胞内72 h。

1.3.10 CCK-8检测

在相应处理后,胶质瘤细胞被接种到96孔板(5 000个细胞/孔)中,37 °C培养48 h,随后将CCK-8试剂10 μL分别加入孔中,37 °C温育2 h,然后使用酶标仪在450 nm处对每个孔的吸光度(D)进行评估。

1.3.11 5-乙炔基-2'-嘧啶核苷(EdU)染色

使用Cell-Light EdU Apollo567体外试剂盒测定细胞增殖,细胞用50 μmol/L EdU温育后,用Apollo染料溶液染色,随后使用荧光显微镜观察EdU阳性细胞。

1.3.12 Transwell小室分析

使用孔径为8 μm的transwell小室分析细胞迁移和侵袭能力,将细胞(1×105)重悬浮于200 μL无血清培养液中,加入上室,下室填充含10%FBS的DMEM(700 μL),温育24 h后,用1%结晶紫对下膜表面的细胞进行30 min的染色,随后用荧光显微镜(购自日本Olympus公司)捕获染色细胞,侵袭实验的条件与迁移实验相同,但transwell板的上室用人工基底膜预覆盖。

1.3.13 细胞凋亡检测

细胞凋亡的检测使用细胞凋亡试剂盒。细胞与Annexin Ⅴ-FITC和碘化丙啶(propidium iodide,PI)在暗室中温育30 min,然后用流式细胞术检测细胞凋亡。

1.4 统计学处理

数据统计分析采用SPSS 22.0及R 4.0.1软件。两组之间的比较用非配对Student’st检验进行分析,多组间比较采用单因素方差分析和Tukey事后检测法。连续性变量数据以±s表示。使用COX回归分析计算风险比(hazard ratio,HR)。采用双侧检验。P<0.05为差异有统计学意义。

2 结 果

2.1 胶质瘤中DelncRNA的识别

从CGGA数据集中鉴定出312个DelncRNA(图1A),并从TCGA数据集中鉴定出975个DelncRNA(图1B)。在两个数据集中识别了11个重叠的DelncRNA,包括RP11-366L20.2、HOXB-AS1、RP4-792G4.2、RP11-93B14.5、HOTAIRM1、AC002454.1、CRNDE、RP11-834C11.5、HOXA-AS2、AGAP2-AS1和CTD-3049M7.1,并用维恩图表示(图1C)。在CGGA和TCGA数据集中,胶质瘤患者中高水平的HOXA-AS2与较差的OS相关(图1D~E,P均<0.01)。此外,我们发现与HA1800细胞相比,T98G、SHG44和U251 MG细胞中HOXA-AS2的表达量更高(HA1800vsT98G:HR = -1.690,95% CI:-2.259 ~ -1.121,P<0.000 1;HA1800vsSHG44:HR = -3.430,95% CI:-3.999 ~ -2.861,P<0.000 1;HA1800vsU251MG:HR = -0.961,95%CI:- 1.530 ~ -0.392,P<0.01,图1F)。上述结果表明HOXA-AS2在胶质瘤中表达升高,并且与OS呈负相关。

图1 胶质瘤中DelncRNA的识别Fig.1 Identification of DElncRNAs in glioma

2.2 HOXA-AS2在GSC中表达上调

本研究发现,SHG44-GSC中CD133 + 细胞的比例明显高于SHG44 细胞(8 1.6%v s23.8%;HR = 0.988,95% CI:53.63 ~ 73.04,P<0.000 1,图2A)。此外,与亲代SHG44细胞相比,SHG44-GSC中CD133(HR = -0.520,95%CI:-0.717 6 ~ -0.321 8,P<0.000 1)、SOX2(HR = -0.482,95% CI:-0.479 4 ~ -0.283 6,P<0.000 1)和OCT4(HR = -0.466,95%CI:- 0.664 3 ~ -0.268 5,P<0.000 1)的表达水平明显升高(图2B)。而且,HOXA-AS2水平在SHG44-GSC中也显著升高(图2C;HR = 0.996,95% CI:2.377 ~ 2.833,P<0.000 1)。

2.3 SHG44-GSC通过外泌体将HOXA-AS2转移到SHG44细胞

SHG44-GSC衍生的外泌体呈圆形和杯状,直径50 ~ 150 nm,表达外泌体标志物CD9、CD63、CD81和TSG101(图3A~3B)。此外,本研究发现PKH26标记的外泌体被SHG44细胞吸收(图3C)。本研究还发现在SHG44细胞中观察到Cy3标记的HOXA-AS2(图3D)。

本研究发现,HOXA-AS2 OE转染的SHG44-GSC细胞(SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE)和SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE衍生的外泌体(SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE-Exo)中HOXA-AS2水平显著升高(P<0.01,图4A、4B和4C)。然而,在HOXA-AS2 shRNA1转染的SHG44-GSC 细胞(SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1)和来自SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1 (SHG44-GSC/HOXAAS2 shRNA1-Exo)的外泌体中该水平却下降。在与SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE细胞共培养的SHG44细胞中,HOXA-AS2水平显著升高,而与SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1共培养的SHG44细胞则表现出相反的结果(P<0.01,图4D)。抑制SHG44-GSC释放外泌体后,SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE或SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1对SHG44细胞中HOXAAS2水平没有影响(P>0.05,图4E)。SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE-Exo增加了SHG44细胞中HOXA-AS2的水平(HR = -2.723,95%CI:- 2.920 ~ -2.526,P<0.000 1),而SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1-Exo则显示出相反的结果(HR = 0.648,95% CI:0.450 5 ~ 0.844 8,P<0.000 1,图4F)。

图2 HOXA-AS2在GSC中表达上调Fig.2 HOXA-AS2 is upregulated in GSC

图3 外泌体颗粒表征Fig.3 Characterization of exosomal particles

2.4 SHG44-GSC来源的外泌体转染HOXAAS2促进胶质瘤细胞增殖、迁移、侵袭和干细胞特性

本研究发现SHG44-GSC/HOXA-AS2OE-Exo显著促进SHG44细胞增殖、迁移和侵袭(P<0.01),而SHG44-GSC/HOXAAS2 shRNA1-Exo则对SHG44细胞增殖、迁移和侵袭无明显影响(图5A、5B和5C)。此外,SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1-Exo显著诱导SHG44细胞凋亡(P<0.01,图5D)。另外Western blot检测结果显示,SHG44-GSC/HOXA-AS2 OE-Exo显著降低SHG44细胞中cleaved caspase-3的表达,而SHG44-GSC/HOXA-AS2 shRNA1-Exo则表现出相反的结果(P<0.01,图5E)。

图4 SHG44-GSC通过外泌体将HOXA-AS2转移到SHG44细胞Fig.4 SHG44-GSC transfer HOXA-AS2 to SHG44 cells by exosomes

3 讨 论

胶质瘤是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,由于胶质瘤的增殖能力极强,具有高度浸润性,导致患者的预后极差,其中HGG患者的中位生存时间仅有13个月[15]。因此进一步明确与胶质瘤侵袭的相关分子机制十分重要。随着分子生物学的发展,分子靶向治疗逐渐成为胶质瘤治疗的新方法,找到特异性的生物标志物是胶质瘤靶向治疗的关键[16]。

lncRNA是一组长度>200个核苷酸的非编码RNA[17],HOXA-AS2是lncRNA的一种,位于人染色体7p15.2,属于HOXA簇成员,以往研究发现HOXA-AS2可通过结合组蛋白去甲基酶1,使染色质发生重塑,从而影响肿瘤细胞增殖与侵袭[18]。既往的研究表明,过表达的HOXA-AS2可以促进视网膜母细胞瘤[19]、胰腺癌[20]、胆囊癌[21]细胞增殖、迁移和侵袭。目前有关HOXA-AS2在脑胶质瘤中的相关研究较少,虽然俞盛健等[22]通过建立风险模型发现HOXAAS2可能是脑胶质瘤的预后风险lncRNA,但是并没有经过实验验证。本研究首次运用TCGA及CGGA 数据库找到HOXA-AS2 为共同的DelncRNA,并分析其表达情况,结果表明,高表达的HOXA-AS2与较差的OS相关,接着我们发现在胶质瘤细胞SHG44中的HOXA-AS2表达量明显高于HA1800细胞,此结果表明HOXA-AS2在胶质瘤中高表达,且与较差的患者预后相关。但其具体机制不清楚,有学者[23]认为HOXAAS2可通过表观遗传学介导Rho家族GTPase3的表达从而促进脑胶质瘤细胞的侵袭,也有学者[24]认为HOXA-AS2可通过microRNA(miRNA/miR)-373/EGFR轴促进胶质瘤的发展。

图5 SHG44-GSC来源的外泌体转染HOXA-AS2促进SHG44细胞的增殖、迁移、侵袭Fig.5 HOXA-AS2 transferred by SHG44-GSC-derived exosomes promoted proliferation, migration, invasion of SHG44 cells

肿瘤干细胞具有自我更新和多向分化的能力,既往研究已经发现lncRNA参与了这一过程,如lncRNA H19的下调已被证明可以抑制胶质瘤细胞的致瘤性和干性[12],然而目前HOXAAS2与GSC的关系在之前尚未确定,在本研究中,我们从SHG44细胞中分离GSC,用流式细胞术检测CD133+富集的细胞,发现SHG44-GSC中CD133+细胞的比例明显高于SHG44。并利用Western blot检测干细胞相关蛋白CD133、SOX2和OCT4的表达水平,发现SHG44-GSC中的上述干细胞相关蛋白表达水平较SHG44中高。并且HOXA-AS2在SHG44-GSC中的表达量也明显高于SHG44。说明lncRNA HOXA-AS2增强了胶质瘤的干细胞特性。

外泌体是大小为40 ~ 160 nm的细胞外囊泡,通过传递细胞内的lncRNA来介导细胞间的相互作用[25]。相关研究已证实外泌体在细胞之间传递lncRNA的作用,如CSC和非CSC[26-27]。以往研究已证实CSC可启动肿瘤生成,并促进多种人癌细胞侵袭和干细胞生长[28-30]。既往研究[31-32]表明,外泌体lncRNA在包括胶质瘤在内的许多癌症的发展中发挥着重要作用,与肿瘤的侵袭、转移等关系密切。Jiang等[33]指出GSC衍生的外泌体miR-944可抑制胶质瘤细胞生长和血管生成,且Conigliaro等[34]证实来自CSC样CD90+细胞的外泌体lncRNA H19可促进内皮细胞的血管生成。另外,Sun等[35]发现GSC衍生的外泌体促进胶质瘤细胞增殖和干细胞特性。本研究首先分离出SHG44-GSC衍生的外泌体,接着用PKH26染液标记,发现标记的外泌体被SHG44细胞吸收,接着将转染了Cy3标记的HOXA-AS2的SHG44-GSC与SHG44细胞间接共培养,结果发现在SHG44细胞中观察到Cy3标记的HOXAAS2。表明HOXA-AS2可通过外泌体从SHG44-GSC转移到SHG44细胞,且通过CCK-8检测及transwell法我们发现SHG44-GSC/HOXA-AS2 OEExo可显著促进SHG44细胞增殖、迁移和侵袭。

综上所述,本研究从组织表达、患者预后和细胞多个层面探究了来自SHG44-GSC的外泌体HOXA-AS2在胶质瘤细胞中的作用,发现其表达量升高,且与患者不良预后相关,可显著促进胶质瘤细胞增殖、迁移、侵袭和干细胞特性,提示HOXA-AS2可能是脑胶质瘤潜在的治疗靶点。但是本研究也有局限性,所以下一步可构建动物模型进行体内验证,并探索下游信号转导通路,以期在此基础上研发相应的小分子药物应用于临床。

利益冲突声明:所有作者均声明不存在利益冲突。

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