山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测
2021-12-31王宪军张焕容任玉鹏朱江江
王宪军,向 华*,张焕容,任玉鹏,朱江江
(1.西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041;2.青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室,成都 610041)
透明质酸结合蛋白(hyaluronan binding protein 4,HABP4)又被称为Ki-1/57,广泛分布于哺乳动物组织中。HABP4蛋白含有多个RGG/RXR盒族,这些被看做是精氨酸甲基化的靶标[1]。透射电镜分析显示,该蛋白不仅存在于细胞质,还存在于细胞核和核孔,推测该蛋白亚细胞定位的多变性可能与该蛋白中存在精氨酸和赖氨酸残基相关,这些残基能与一些带负电荷的生物大分子相结合,包括葡糖氨基葡聚糖、RNA、透明质酸,因此,它也被称为细胞内透明质酸结合蛋白,这也暗示了HABP4蛋白可能在细胞内发挥着多种功能[2]。
HABP4蛋白最初在细胞内被发现可作为单克隆抗体Ki-1的细胞内交叉反应物,且是第一个用于特异性检测霍奇金淋巴瘤恶性细胞的抗体[3]。尽管HABP4和霍奇金病之间关系尚不清楚,但研究发现,HABP4蛋白参与了肿瘤的发生,如Gray-Mcguire等[4]在分析家族性结肠癌的风险相关SNP中发现,其和HABP4的SNP存在强烈的不平衡性。此外,HABP4蛋白作为转录因子复合体,可通过与多种蛋白相互作用,在细胞转录控制与基因表达的调控中起着至关重要的作用。Lemos等[5-7]发现,HABP4蛋白与染色质重塑蛋白(chromodomain helicase DNA binding protein 3,CHD3)、转录因子(myocyte enhancer factor 2C,MEF2C和p53)相互作用后在生物体转录调控方面直接或者间接地发挥作用。Bressan等[8-11]报道,HABP4蛋白与hnRNPQ(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein)和SFRS9(arginine/serine-rich 9)蛋白作用后调控mRNA前体的拼接,以及与 RACK1(receptor for activated C kinase 1)、CIRP(cold inducible RNA binding protein)、FMRP(fragile X mental retardation protein)和RPL38(ribosomal protein L38)蛋白作用后调控蛋白的翻译。Bressan等[8]进一步研究发现,HABP4蛋白通过与富U RNA探针的结合参与RNA的新陈代谢过程,且具有深入调节mRNA前体拼接和翻译方面的功能。……
