基于流式细胞术和生物信息学技术的AML患者骨髓细胞代谢分析研究
2021-12-22王浩雨付伟超于文颖梁昊岳
王浩雨,付伟超,于文颖,梁昊岳
(中国医学科学院血液病医院,中国医学科学院血液学研究所,实验血液学国家重点实验室,国家血液系统疾病临床医学研究中心,天津 300020)
0 引言
急性髓细胞白血病(acute myelocytic leukemia,AML)是最为常见的一类急性白血病,这类疾病的发病机制十分复杂,患者预后情况普遍不理想。探究AML患者骨髓细胞的组成情况和比例,进而分析AML患者的骨髓细胞代谢情况,对AML发病机制的研究具有重要作用[1]。在目前常用的分析方法中,使用流式细胞仪可以准确地检测样本中各种细胞的组成和比例,因此流式细胞术是开展AML基础和临床研究不可或缺的方法[2-3]。在AML患者骨髓中,正常细胞和AML细胞主要以单细胞形式存在,即为天然单细胞悬液[4]。研究人员可以使用不同的荧光素耦联抗体来分别标记AML患者骨髓中的淋巴细胞、单核细胞、粒细胞和AML细胞等细胞群[5]。传统的流式分析方法以流式散点图为依据来区分各种细胞群体,用散点图的聚群程度来计算各细胞群体的比例[6]。目前,应用包括t-分布邻域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding,t-SNE)算法、统一流形逼近与投影(uniform manifold approximation and projection,UMAP)算法和基于快速傅里叶变换加速插值的t-SNE(about fast Fourier transform-accelerated interpolation-based t-SNE,Flt-SNE)算法在内的3种FlowJo生物信息学方法,可以直观地描述淋巴细胞、单核细胞、粒细胞和AML细胞的分布和比例。与此同时,利用热图分析可以发现AML患者骨髓中各种细胞的抗原表达情况存在差异[7]。在基础和临床研究中,因具有快速灵敏、操作便捷、与生物信息学紧密结合的技术优势,基于流式细胞仪的多激光多色流式分析和高速高通量流式分选技术在白血病患者代谢研究中具有一定的应用价值。……
