云南省野猪源猪瘟病毒E2 及5'NTR基因序列测定分析
2021-12-11赵焕云张海楠鲁富有解明华曾邦权陈云明李锡慧张文东
赵焕云,张海楠,鲁富有,解明华,曾邦权,陈云明,吕 嵘,李锡慧,张文东
(1.云南省动物疫病预防控制中心,云南昆明 650000;2.普洱市动物疫病预防控制中心,云南普洱 665000;3.宁洱县动物疫病预防控制中心,云南宁洱 665199;4.临沧市动物疫病预防控制中心,云南临沧 677000;5.玉溪市动物疫病预防控制中心,云南玉溪 653100)
猪瘟(classical swine fever,CSF)是由猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)感染猪引起的一种临床上以沉郁、多器官出血、高热、高死亡率为特征的高度接触性传染病,是危害养猪业的重要传染病之一,被世界动物卫生组织(OIE)列入须通报动物疫病名录[1-2],也是我国农业农村部认定的一类动物疫病,是《国家中长期动物疫病防治规划(2012—2020 年)》中明确的优先防治病种[3-6]。
CSFV 属于黄病毒科(Flaviviridae)瘟病毒属(Pestivirus),其基因组为12 kb 左右的单股正链RNA,含有1 个大的开放阅读框(open reading frame,ORF)。ORF 编码的大蛋白在病毒与宿主蛋白酶作用下形成4 个结构蛋白(C、Ems、E1 和E2)和8 个非结构蛋白(Npro、P7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A 和NS5B)[7]。CSFV 只 有1个血清型,依据E2基因分为3 个基因型(1~3)、11 个亚型(1.1~1.4、2.1~2.3、3.1~3.4),其中2.1亚型又可进一步分为2.1a、2.1b、2.1c 和2.1d 共4个分支[8-10]。野猪是CSFV 的自然贮存宿主。我国野猪资源丰富,但仅有少量野猪感染CSFV 的报道[11-12],更未见到关于野猪源CSFV 的分子流行病学报道。
本研究对近期从云南省宁洱县同心镇山林中2 头死亡野猪分离到的2 株CSFV 毒株(YNPEwildboar3180919、YNPEwildboar4180919)进行了E2及5'NTR 基因序列测定分析,以了解云南省野猪体内CSFV 的基因变异情况,从而为云南省CSF 防控提供参考。
1 材料与方法
1.1 样品
2 份猪脾、肺组织样品,分别来自宁洱县2 头病死野猪,低温运输到实验室。
1.2 质粒与菌种
TaKaRa pMD18-T 载体,购自宝生物工程(大连)有限公司;……
