闫明慧，刘柯，王满，吕颖，张倩

信阳10号叶绿体基因组及其系统进化

闫明慧1，刘柯2，王满2，吕颖1，张倩1

1. 信阳师范学院生命科学学院/河南省茶树生物学重点实验室，河南 信阳 464000；2. 信阳师范学院国教学院，河南 信阳 464000

信阳10号是适制信阳毛尖的国家级良种，然而其起源以及与其他茶树品种之间的进化关系尚不清晰。利用MGI2000平台对信阳10号进行测序，组装获得了信阳10号的完整叶绿体基因组并对其结构进行分析，同时，为探究信阳10号与其他茶树的进化关系，构建了46个物种的叶绿体基因组系统发育树。结果表明：（1）信阳10号叶绿体基因组大小为157 041 bp，包括2个反向重复区（IR，26 078 bp），1个大单拷贝区（LSC，86 594 bp）和1个小单拷贝区（SSC，18 291 bp）；共注释得到叶绿体基因113个，包括79个蛋白质编码基因，30个tRNA基因和4个rRNA基因。（2）在信阳10号的叶绿体基因组中共检测到了74个SSR位点，大部分SSR由A/T组成。（3）贝叶斯法构建的系统进化关系树显示，信阳10号与福建铁罗汉关系最近，并且两者的叶绿体基因组完全相同，推测可能来源于相同母本；信阳10号与韩国茶Chamnok和Sangmok、福建白鸡冠、云南德宏茶也有较近的亲缘关系。研究结果为进一步探究茶树起源与演化以及分子育种提供了基础。

茶树；信阳10号；叶绿体基因组；系统发育分析

茶树[(L.) O. Kuntze]是一种自交不亲和的多年生木本植物，种间频繁杂交导致基因组杂合度高（2.8%），同时核基因组较大（约3.0 Gb）且重复序列含量极高[1]，很难筛选出有效的核基因组数据来区分种间关系。以往的研究多利用随机扩增序列的多态性（Randomly amplified polymorphic DNA，RAPD）作为分子标记探究茶树品种或茶属内部的系统进化关系[2-5]。……