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lncRNAs在骨关节疾病中的作用研究进展

2021-12-10胡毅成仕明谭云

河北医药 2021年23期
关键词:骨关节软骨调控

胡毅 成仕明 谭云

近些年来,骨关节疾病的发病率有明显升高趋势,且发病人群呈现年轻化的趋势,骨关节疾病的主要表现为关节疼痛,随着时间延长关节损伤逐渐加重,关节的反复疼痛让患者受到极大的折磨[1]。骨关节疾病的致残率较高,许多患者因关节疾病而失去行动自由,传统的治疗骨关节疾病诊疗手段不能在根本上解除患者疼痛,许多患者最终选择采用关节置换术来提高生活质量[2]。随着分子生物学技术的不断发展,研究者在对骨关节疾病的诊疗方面也有重大突变,这给骨关节疾病患者带来了福音。以往对基因功能研究更多的在编码基因方面,对非编码的基因关注度很低,随着生物技术发展,已经完成可了多个基因组计划,并且使用深度测序技术,多个研究者发现,有超过80%的基因组可被转录为RNA,有62%的基因组也发生转录,但转录为非编码RNA(ncRNA),这些ncRNA并不是大家所公认的“副产品”或者是“暗物质”,它的作用广泛,可介导、调控或参与多种疾病的发生及发展进程[3]。依照非编码RNA长度可分为>200核苷酸的lncRNAs及≤200核苷酸的短链非编码RNA,≤200的RNA多为microRNA,近些年来,microRNA在多种疾病中的研究较多,大量研究表明,microRNA参与OA、RA、系统性硬化症、系统性红斑狼疮等[4,5]。目前对lncRNAs的研究有限。lncRNAs的发现是多组学领域的一个重要的研究进展。研究显示,lncRNAs可从转录水平、转录后水平及染色质重塑等多个层面上调控基因表达[6]。大量研究也证实,lncRNAs表达紊乱及调节失调可引起免疫功能失调、肿瘤及神经功能失调等多种疾病的发生[7]。近年来的研究证实,表观遗传学在OA、RA、骨肿瘤等骨和关节疾病发生发展中有重要作用[8]。多项研究表明lncRNA在骨关节疾病中的表达水平发生改变,但仅有少量的lncRNA功能被验证[9]。这部分前人的研究成果解释了lncRNA在骨关节疾病中的一些分子机制及重要功能,为今后lncRNA的研究提供了重要的线索。本文就lncRNA的生物学功能及在一些骨关节疾病中的相关研究作一综述。

1 lncRNAs的概述

lncRNA是一类缺少可读性及蛋白功能的RNA,存在带多聚腺苷酸(polyA)尾及不带多聚腺苷酸尾两种形式,常常显现出二级茎环样结构或三级结构,是一类具有保守性的ncRNA[10]。由于lncRNA数量庞大、种类繁多,远超过编码疾病,因而目前对lncRNA尚没有规范的分类方法,依据编码基因和lncRNA在基因组中所处的位置,可将lncRNA分为正义lncRNA、反义lncRNA、双向lncRNA、基因间lncRNA及内含子lncRNA。依据lncRNA的作用形式可将lncRNA分为顺式lncRNA和反式lncRNA[11]。

随着对lncRNA研究的深入,研究者发现,lncRNA比mRNA的表达谱有更加特异性,在不同的发病阶段及所用的细胞和组织不同,所检测的lncRNA表达可能会有所不同。同时lncRNA和mRNA间的表达谱也有相关性,以上的研究提示,在基因的表达网络中,lncRNA可能是一类共调控基因[12,13]。许多lncRNA的亚细胞定位有特异性,如XIST位于失活的X染色体上、GAS5位于细胞质[14]。

lncRNAs可从多个水平调控基因表达,具有作用机制有以下几个方面:直接与转录因子结合或协同作用,在转录水平影响靶基因表达,还可诱导基因活化加速,促发细胞转录程序,从而使转录进程加快[15];可在翻译水平参与多聚核糖体形成的调节,还可与真核生物翻译其实因子相结合[16];可参与染色质表观修饰,通过对组蛋白乙酰化修饰及染色质甲基化水平改变,从而调控靶基因表达[17];可参与包括蛋白质泛素化修饰等翻译后水平的调控[18];可参与降解mRNA及mRNA选择性剪接等转录后修饰[19]。

2 lncRNA与OA

趋化因子、氧化应激和代谢、生长因子等在OA发展进程中已经有大量的研究,但到目前为止,仍没有一种能降低OA发生的有效方法。近年来,多项研究表明,lncRNA的表观遗传修饰在OA发展过程中有关键的作用。如Zhang等[20]研究显示,lncRNA-UFC1在 OA患者中表达明显降低,功能分析表明,UFC1对软骨细胞有促增殖和抑凋亡作用,此外,UFC1通过调节mir-34a的影响OA软骨细胞的存活,提示UFC1可能是OA诊疗的一个的潜在靶基因。Wang等[21]研究显示,OA软骨中lncRNA-UCA1上调表达,UCA1过表达可抑制软骨细胞中mir-204-5p表达,mir-204-5p在OA软骨中表达下调,mir-204-5p的表达与UCA1表达呈现负相关,过表达UCA1可促进软骨细胞增殖,抑制Ⅱ型胶原和Ⅳ型胶原表达,而过表达mir-204-5p则抑制软骨细胞的增殖,促进Ⅱ型胶原和Ⅳ型胶原表达,提示过表达UCA1可通过抑制mir-204-5p表达来调节软骨细胞的增殖和胶原的表达。以上前人的研究提示lncRNA的表观遗传干预能力,可有望研制出有效的骨关节疾病靶向治疗药物。

lncRNA在多种疾病发生发展过程中有重要作用,但目前在OA中的发病机制尚未完全明确。在OA软骨组织中lncRNA表达不一,有些lncRNA呈现高表达,有些lncRNA呈现低表达,均可通过不同的调节途径影响OA进程。Fu等[22]采用高通量基因芯片技术研究膝关节OA软骨组织中lncRNA表达谱的变化,发现上调的lncRNA有3 007种,下调的lncRNA有1 707种。Xing等[23]研究者也得出了同样的结论。

2.1 H19印记基因 H19是一个位于染色体11p15.5上的2300bp长的呈现出父系印迹的lncRNA,在早期胚胎期中被发现,并呈现出高水平的表达,出生后表达量逐渐降低[24]。在多种肿瘤研究中发现,H19异常表达可影响肿瘤细胞生长,如王珏等[25]研究显示,H19在胰腺癌细胞高表达,通过RNA干扰技术抑制其表达,发现抑制H19表达的胰腺癌细胞克隆形成数、细胞侵袭及转移能力明显提高;吴海权等[26]研究显示,H19在人多形性胶质母细胞瘤(GBM)中呈现高表达,过表达H19可增强GBM增殖、侵袭和迁移能力,加速细胞周期S期进程,并抑制细胞凋亡,从而促进GBM的致癌性。一些研究也表明H19在OA软骨组织中上调表达,在TNF-α及IL-1β刺激下H19在软骨中的表达被抑制[23]。以上研究提示H19与OA软骨细胞代谢间存在密切相关,可作为一个反映软骨细胞代谢水平的标志物。

2.2 MEG3母系表达基因3(MEG3) MEG3是一个印记基因,在人类染色体上定位于14q32.3,是一个常见的lncRNA,具有肿瘤抑制作用,可编码一段大小约为1.6kb的lncRNA,广泛表达在正常组织中,而在肿瘤中出现明显的表达缺失,可通过抑制多种肿瘤血管形成,从而达到抑癌的效应[27]。有研究表明,MEG3骨关节疾病发生发展有关。刘振峰等[28]研究显示,lncRNA MEG3在OA软骨组织中的表达明显低于在正常软骨组织表达,且随着软骨退化程度加大,lncRNA MEG3表达量降低,OA软骨组织中VEGF的mRNA及蛋白表达均显著高于在正常软骨组织表达,VEGF的表达可随着软骨退化程度加大而有明显增加,lncRNA MEG3和VEGF间的表达有负相关,提示lncRNA MEG可能通过对血管生成的调控,进而影响原发性OA发展进程。

2.3 lncRNA-CIR Liu等[29]通过高通量芯片分析OA软骨细胞中差异表达的lncRNA,发现有152中lncRNA表达水平改变,发现lncRNA-CIR有异常表达,而lncRNA-CIR表达的变化与软骨损伤有关,使用TNF-α及IL-1β处理后的软骨细胞中lncRNA-CIR 表达升高,而抑制lncRNA-CIR的表达后,可促进蛋白聚糖及胶原形成,并能抑制MMP13和ADAMT55等细胞外基质降解酶表达,过表达lncRNA-CIR与之相反。Lu等[30]研究显示,在OA患者中,lncRNA-CIR显著上调表达,mir-130a下调表达和bim上调表达。生物信息学分析预测mir-130a是lncRNA-CIR和bim的靶基因,敲除lncRNA-CIR可明显增加bim的表达,mir-130a显著抑制了bim表达,同时细胞活性氧水平、炎性介质释放、细胞凋亡和相对荧光素酶活性均明显增加。Li等[31]研究显示,lncRNA-CIR在OA患者中显著上调表达,同时下调mir-27和上调MMP13表达。生物信息学分析预测,mir-27是lncRNA-CIR和MMP13的靶点,lncRNA-CIR过表达可明显增加MMP13表达,而mir-27则显著抑制了mmp13的表达,同时mRNA水平、蛋白质水平和相对荧光素酶活性的增加。提示lncRNA-CIR可能是OA诊疗的一个重要靶点。

2.4 生长停滞特异性转录本4(growth arrest-specific 5,GAS5) GAS5是一种可负性调节细胞生长的lncRNA分子,与糖皮质激素受体反应元素(GRE)有相似的结构,可与其竞争结合糖皮质激素受体,或抑制GRE下游基因,如凋亡相关的cIAP2表达,从而诱导细胞的凋亡[32]。在细胞缺乏生长因子及营养时,GAS5上调表达,当细胞处于饥饿状态时,GAS5可调节GRE的活性,进而影响细胞生长及代谢[33]。Song等[34]研究显示,GAS5在OA软骨细胞中有明显的上调表达,其高表达可促进金属蛋白酶及蛋白聚糖酶ADAMTS-4表达,还可促进软骨细胞凋亡及抑制自噬途径,从而引起关节损伤。

3 lncRNA与类风湿关节炎(RA)

RA是一种慢性系统性自身免疫性疾病,以关节病变为主要特征,病理表现为间质有大量炎细胞浸润、软骨和骨组织的破坏、滑膜细胞持续增生等,其中慢性炎症及滑膜关节的破坏是RA的主要主要的病理改变[35]。有研究表明,lncRNA参与自身免疫性疾病的调节[36]。有研究者通过对人血清及血单核细胞外泌体实验分析,发现TUG1、LUST、SNHG4、MEG9等lncRNA在RA患者中的表达高于正常者,PRINS、PR反转录体、HOXA3as等lncRNA明显下调表达[37]。多项研究也表明,lncRNA异常表达与RA发生发展密切相关。洪宏海等[38]研究显示,RA患者滑膜组织中MT1JP的表达水平相对于正常组织降低,其表达水平的变化与血清中IL-6和IL-8等炎性因子水平呈现出负相关,MT1JP表达被抑制后,细胞中的这这些因子的分泌量增加,且p53表达受到抑制,提示MT1JP可能通过对p53表达的调控,进而促进炎性反应。Yang等[39]研究显示,紫草素可降低RA小鼠软组织和骨骼损伤,可显著增强NR024118和SOCS3的表达,抑制IL-6、IL-8和MMPS的分泌和表达,且可减弱IL-1β对RA滑膜成纤维细胞的增殖影响,此外,紫草素可增加NR024118启动子处的乙酰化,过表达NR024118或干扰NR024118表达均可改变SOCS3的表达,干扰NR024118表达后,可逆转紫草素对MH7A细胞促炎因子、SOCS3和MMPS水平影响。对于RA的治疗,一直以来都是医学界的一个很大的难题,且对RA的治疗也无明显的的进展。以上研究提示在RA中lncRNA存在异常表达,这些研究可为免疫相关疾病的研究奠定了一定的基础,提示这些lncRNA可能是RA诊疗的标志基因。

4 lncRNA与骨质疏松症(OP)

OP是由于骨的形成与吸收不平衡,引起单位结构内骨量下降及骨的微结构被破坏,在参与OP代谢失衡动态平衡过程中,主要涉及到成骨细胞和破骨细胞等的分化调节,同时与骨代谢相关的信号途径也发挥了重要的作用[40]。随着中国OP患者年龄的逐渐增长,在该病的诊断及治疗上要有突破和创新,近些年来,基因在OP中的作用受到广泛关注。lncRNA在OP中的作用也有相关的报道。高艳等[41]研究显示,BMP-2诱导C2C12成骨分化过程中,LncRNA AK051397在BMP-2诱导C2C12成骨分化中的表达升高,AK051397表达被抑制后,ALP、SP7表达降低,MYOG表达升高,提示在C2C12细胞中,LncRNAAK051397对成骨的分化有促进作用,对细胞成肌分化有抑制作用。BMPs是TGF-β家族成员之一,有多种亚型,BMPs/TGF-β信号途径可通过Smad信号通路和p38信号通路调控BMMSc内Runx2基因表达,可调控BMMSc向成骨细胞分化,也可对成骨细胞分化和功能进行调节,进而在OP平衡中发挥重要作用[42,43]。Wei等[44]研究显示,lncRNA HOTAIR可通过BMPs/TGF-β信号通路,调节miR-17-5p及靶基因Smad7表达,从而调节成骨细胞的增殖和分化。Zhang等[45]研究分析在BMMSc分化为成骨及破骨细胞过程中,lncRNA 表达谱及功能的变化,发现lncRNA xr-111050可通过调控MAPK信号途径,调节BMMSc向成骨细胞或破骨细胞分化,可能成为骨再生及骨修复的一个靶点。以上的研究提示lncRNA在OP发病调控及治疗中有重要作用,作为OP骨代谢的标志物,lncRNA对OP病理变化影响及对骨代谢相关信号通路的调控的方式,可为OP诊疗及预后判断新的靶标。

5 lncRNA与炎症通路调控机制

OA的主要病理表现为滑膜炎症及软骨的降解,近些年来,越来越多的lncRNA被确定为与调节炎症信号通路有关,且在关节组织中呈现表达。目前lncRNA与OA相关的炎症型号通路间关系并且完全明确,因此,确定lncRNA对OA中信号通路的调控作用,可能成为一个重要的治疗方向。p38/MAPK信号通路、NF-κB信号通路、TLR信号通路和花生四烯酸途径等是常见的炎症信号途径,且lncRNA与以上信号途径间存在调控关系。现就lncRNA与以上信号通路间的关系进行描述。

5.1 p38 MAPK信号通路 丝裂原活性蛋白激酶(MAPK)是一类重要的信号转导通路,大多数细胞均有该信号途径的存在,MAPK信号主要分布在细胞质,p38MAPK是一个MAPK家族的关键成员,在多种因素刺激作用下,如氧化应激、损伤等,p38可发生磷酸化,进而参与细胞生长、细胞凋亡、炎症等过程[46,47]。目前为止,已有多项研究表明,OA进展与MAPK信号通路间存在密切关系。在OA患者研究中发现,MAPK信号在软骨内被激活,与正常组织比较,c-Jun氨基端激酶及磷酸化的p38表达均有显著的升高[48]。也有研究指出,MAPK信号在对软骨细胞MMP分泌的调控过程中也发挥关键作用,在OA进程中,所产生的骨基质碎片,如纤连蛋白和胶原蛋白等,均可增强MMP在细胞中的分泌,此过程有MAPK信号的参与[49]。此外,多项研究表明,软骨细胞凋亡与p38MAPK信号通路的调控有关,潘建科等[50]研究显示,龙鳖胶囊可对p38及磷酸化的p38过量表达进行抑制,从而使p38MAPK在OA软骨细胞中的活化受到抑制,从而对软骨损伤有明显改善作用。在OA模型的临床研究中发现,使用p38抑制剂后,软骨退变可明显得到改善[51]。关于p38信号通路的lncRNA调控,目前的研究很少,有研究表明,lncRNA-MALAT1可调控p38MAPK信号,MALAT1是一个在非小细胞肺癌最早被发现的基因,在哺乳动物中有高度的保守性,提示MALAT1可能有重要的生物学功能,多项研究表明,MALAT1在多种肿瘤中有明显的高表达,其过量表达对肿瘤生长有促进作用[52]。此外,也有研究表明,MALAT1与炎症间有相关性,可通过活化内皮细胞SAA3,增加细胞IL-6分泌,诱导ROS的产生,增加细胞炎性反应[53]。

5.2 NF-κB信号通路 NF-κB是TFs家族成员,广泛存在于真核细胞,是一种具有多项转录调节作用的蛋白因子,在大多数炎性反应及免疫应答过程中发挥重要作用。NF-κB的活化是一个复杂过程,当结合NF-κB的多个位点受到活化因素刺激后,NF-κB被激活,IκB被磷酸化,之后,IκB与NF-κB分离,NF-κB迅速进入核,而后发挥转录因子的功能,并诱导一些靶基因的表达,如cyclinD1、survivin等[54]。多项研究表明,OA损伤与NF-κB信号间存在相关性[55]。有研究显示,有一定量的NF-κB在OA滑膜中存在,抑制NF-κB信号后,关节炎损伤程度可明显得到改善[56]。有研究显示,lncRNA-21低表达水平可增加RA患者中NF-κB的活性,甲氨碟呤(MTX)对RA患者有治疗作用,lncRNA-21可抑制NF-κB信号,MTX可增加lncRNA-21的表达,进而抑制NF-κB信号途径[57]。Trenkmann等[58]研究显示,在RA滑膜成纤维细胞lncRNA HOTAIR表达明显降低,HOTAIR的沉默与基质降解酶和NF-κB活性的上调有关,意味着抑制HOTAIR参与RA滑膜成纤维细胞生长。

5.3 TLR信号通路人类Toll样受体(TLR) TLR是一种Ⅰ型跨膜糖蛋白,近些年来发现的一类细胞表面信号转导跨膜受体,由三部分组成,即胞外和胞内结构域及跨跨膜区。作为一个固有免疫受体,TLR在T细胞、B细胞、自然杀伤细胞及树突状细胞等各种免疫细胞中有关广泛的分布,随着对TLR研究的深入,越来越多的研究表明,在非免疫细胞中也发现TLR的存在[59]。有研究显示,在OA的滑膜成纤维细胞及软骨细胞中均有TLR的表达[60]。Kim等[61]研究显示,TLR2 的mRNA表达在所有的OA患者膝关节软骨细胞样本均可以检测到,在OA患者样本中的一半样本也可检测到TLR2的mRNA表达,同时检测TLR在OA患者髋/膝关节软骨水平,发现与正常软骨及非损伤区TLR表达相比,TLR2和TLR4在软骨损伤区的表达均有明显升高,提示TLR2和TLR4在OA软骨组织中表达增强。Toll受体可引起许多lncRNA表达,lncRNA-Cox2位于PTGS2基因附近,TLR2信号通路激活后可引起lncRNA-Cox2上调表达[62]。张飞飞等[63]研究显示,Pam3CKS4可增强lncRNA NEAT1 NEAT1的表达水平,NEAT1的表达被抑制后能明显部分降低TLR2信号活化所引起的趋化因子、细胞因子的表达,如CXCL10、CCL8及IL-6等,受NEAT1调节的基因均为TLR2持续缓慢诱导基因。

5.4 花生四烯酸(AA) 炎症的调节及控制由炎性介质介导,AA是一类关键的可对炎症介质进行调控的长链多不饱和脂肪酸(LC-PUFAs)的衍生物[64]。AA代谢产物白三烯及前列腺素(PG)是炎性反应介质,在OA中存在差异表达[65]。在炎症及疼痛治疗方面,对AA途径的靶向抑制是一直以来的一个极其重要的研究方面。环氧化酶(COX)是一个在AA代谢及PG和血栓素A2(TXA2)生物合成过程中的非常重要的限速酶,COX-2的选择性抑制剂对OA症状有明显改善作用[66]。有研究显示,lncRNA PACER基因可控制COX-2基因开或者关,COX-2基因的活跃程度与癌症、炎症等均存在密切关系[67]。PACER基因可阻断p50结合,增强COX-2活性。研究显示,PACER在非OA软骨及膝关节OA和髋关节OA中存在差异表达[68]。

6 结语及展望

随着对lncRNA研究的深入,lncRNA在细胞内的作用已受到广泛的关注。越来越多的研究证实lncRNA是一个可在转录、翻译及染色质修饰等多个方面对基因表达调控的重要分子。目前研究仍发现一些lncRNA与骨关节疾病发生发展密切相关。总的来说,目前的研究揭示了少部分的lncRNA与骨关节疾病进展存在相关性,但lncRNA在OA中的作用仍存在一些亟待解决的问题。如在OA发病过程中,有哪些差异表达的lncRNA,且这些lncRNA是否在骨的破坏中有重要作用,且具体机制是什么,尚未明确;基因芯片已证实一些lncRNA与骨关节疾病进展密切相关,但哪些lncRNA起在OA进展中起到主导作用,以及对其的作用的调控机制如何,尚无明确的定论;在OA进展及软骨分化过程中,可以有目的性的选择哪些lncRNA进行干预,从而达到对软骨损伤修复改善的目的。因此,对lncRNA在骨关节疾病中的作用,还需做进一步深入的探究。

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