单细胞转录组学分析在胰岛β细胞生理研究中的应用进展
2021-12-05郑泽宇
内科理论与实践 2021年6期
陈 刚, 郑泽宇
(1.福建省立医院内分泌科,福建 福州 350001;2.福建医科大学省立临床医学院,福建 福州 350100)
自从40多年前科学家发现了RNA印迹法(northern blotting),单细胞表型研究就成为了生物学家的梦想。以往研究中需要百万计的细胞才能获取足量的RNA来检测单个基因mRNA水平,而现在通过单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq),可以轻松确定单个细胞中各基因的表达水平。如今,scRNA-seq也为胰岛细胞生物学研究提供了极大便利。过去3年间已有一系列关于小鼠和人类胰岛scRNA-seq分析的文献资料相继发表。scRNA-seq分析能够帮助人们了解已知细胞特征,并发现已知不同内分泌细胞(如产生胰高血糖素的α细胞和产生胰岛素的β细胞)之间的异质性,从而使细胞亚型分类更科学。
单细胞转录组分析研究进展
新一代测序技术的发展和应用给生物学研究带来了极大的便利和突破,而传统的批量测序(Bulk RNA-seq)作为其中的突出代表,在科学研究中发挥着极大的作用。尽管从一群细胞中获得全基因组范围的RNA表达量在生物学机制研究中十分有利,但是这种方法只能获得所有细胞基因表达的平均水平,无法体现细胞的异质性。单细胞测序是在单个细胞水平对细胞转录组进行高通量测序的一项新技术,其原理是将分离的单个细胞中微量mRNA通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本细胞异质性以及常规RNA-seq被掩盖的细胞群内的转录组异质性难题,有助于发现新的稀有细胞类型,并深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。……
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