王磊 闵佳鑫 鄂志国

（中国水稻研究所/水稻生物学国家重点实验室, 杭州310006；第一作者：wanglei05@caas.cn；*通讯作者：ezhiguo@caas.cn）

R 语言已经是工业界和学术界的主流和标准计算语言之一，可能已是科学研究中数据分析最流行的计算语言[1-4]，更有学者认为R 语言是“免费、易学、最热门、最公开透明、最全面、最新最快的统计软件”[3]。但在中国知网（https://www.cnki.net/），选择年份从 2000 年至2020 年，按照关键词“R 语言”或者“R 软件”对我国几种主要农学类学术期刊进行全文检索，检索到《中国农业科学》100 篇，《作物学报》39 篇，而《中国水稻科学》只有6 篇，《杂交水稻》3 篇（其中1 篇是综述）。检索结果中，不排除只是在综述或者讨论中提到名称，但也有可能个别论文所作的试验数据分析采用了R 语言但没有注明而没有检索到。不过，总的来说，检索到的文章不少是组学研究和分子生物学研究领域的工作，农业试验数据分析，特别是水稻科研和基础的大田试验数据分析很少采用R 语言，其中的原因可能是：（1）农业科研工作者的软件使用习惯，譬如一直习惯采用SAS或者SPSS 等商用软件；（2）对R 语言了解不多或者很少接触；（3）也有可能是 R 语言的使用环境（R 软件）不同于菜单式的软件而需要编写代码的特点，妨碍了R语言的普及使用。

我们以两篇文章的篇幅，介绍R 语言的基本知识点以及在农业试验数据上的基本应用，希望有助于农业科研工作者开始尝试使用R 语言分析试验数据。本文先介绍R 的下载安装、起步使用以及R 的界面以及各项功能，接着介绍程序包的安装和调用，然后是如何直接输入试验数据或者从文本或者Excel 工作表读入，最后通过简单的示例介绍利用R 语言作一些简单的统计分析。……