韩沅均，莫天录，邓子新，张琪，丁伟

（1 上海交通大学生命科学技术学院，微生物代谢国家重点实验室，上海 200240；2 复旦大学化学系，上海 200243）

核糖体翻译后修饰肽（ribosomally synthesized and posttranslationally modified peptides，RiPPs）存在于所有的生物界中，构成了具有结构和功能多样性的一大类天然产物家族［1-2］。随着基因组数据的不断增长，分析显示大量具有结构多样和活性潜力的RiPPs以及所涉及的生物合成酶仍未被挖掘和鉴定。在大多数RiPPs的生物合成途径中，核心肽部分氨基酸残基间的环化是一种常见的后修饰方式［3］。目前为止，常见的RiPPs的环化的种类有硫醚交联（lanthipeptide［4-6］和 sactipeptide［7-9］）、二硫键 （cystine knot proteins［10］）、N-to-C 环化（orbitides［11-13］和 cyclotides［14-16］）、噻唑和唑杂环（cyanobactins［17-19］）或取代吡啶（thiopeptides［20］）。通常这些环化修饰增加了RiPPs结合亲和性和蛋白水解稳定性，导致它们产生多样化的生物活性，从而具有良好的药物发展前景。

近年来，含有环番结构的RiPPs 化合物相继被发现［21-22］。这些环番结构通常是由一个氨基酸的芳香族碳与另一个氨基酸的β-碳交联成为C－C 键或C－O 键。如 Streptide［23］、Darobactin［24］和 Triceptide-Fxs［25］。它们在细菌中的生物合成途径通常涉及S-腺苷甲硫氨酸自由基（rSAM）酶，该类酶能够裂解SAM 形成5'-脱氧腺苷（5'-dA）自由基，然后攫取底物上的一个氢原子生成底物自由基，进一步生成结构多样化的最终产物［26］。Darobactin 是Ⅰmai 等发现的一种新型作用机制的优秀的抗革兰氏阴性菌抗生素，其是典型的含有环番结构的RiPP（图1）。Xye 类核糖体肽因为其主要在Xenorhabdus、Yersinia和Erwinia三 个 属 的 菌 中 被发现而得名［22］。这类RiPPs前体肽的核心肽区域和darobactin 的核心肽均富含芳香氨基酸，但是一般Xye 基因簇中的 rSAM 酶与 darobactin 的 rSAM 修饰酶序列上差异较大［22］，预示着二者修饰功能上存在一定的差异，从而导致最终的成熟天然产物的结构具有更大的多样性。……