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农作物种子检测中SSR与SNP分子标记方法的比较分析

2021-11-29李巧英

中国种业 2021年12期
关键词:检测

李巧英

(山西省农业种子总站,太原 030006)

随着分子生物学理论和分子标记技术的发展,分子标记逐渐应用在农作物种子检测中,实现了在基因水平上分析农作物品种信息。品种间的差异通过多个位点DNA 序列长度不同或碱基组成不同表现出来,利用不同检测平台展示指纹信息,便于分析各品种不同位点的基因型,进行比对。分子标记法快速检测,避免了应用传统检测方法受自然环境条件和人员主观因素等影响的困惑。

分子标记是一种以DNA 序列变异为基础的标记,在生物体基因组中,DNA 序列差异是生物遗传多样性的直接体现,通过研究这些差异可进行品种间亲缘关系的分析。分子标记在生物体中分布广泛,多态性高,信息量丰富,遗传稳定,利用分子标记进行种子基因分析,实验结果及时可靠,在农作物种子质量监控、品种身份鉴定、品种权保护、品种审定、基因定位和遗传育种等方面具有重要的意义。经过研究与改进,第1 代分子标记方法由于各种问题与缺陷逐渐被淘汰,目前SSR 和SNP 分子标记是农作物种子检测中应用的优良标记方法。

1 检测原理

SSR(简单重复序列)第2 代DNA 分子标记,是生物体内存在的以l~6 个核苷酸为重复单元的DNA 序列,由于寡核苷酸重复序列和重复次数不同形成长短不一的核苷酸片段。将作物品种在某一位点的特异核苷酸序列作为标记,根据核苷酸链两端保守的基因序列设计不同的引物,将这些DNA 片段扩增出来,分析比较待测样品在该位点的基因序列,确定品种基因型,分析品种间的遗传关系。……

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