赵卫松，郭庆港，董丽红，王培培，苏振贺，张晓云，鹿秀云，李社增，马平

枯草芽孢杆菌NCD-2对棉花根系分泌物L-脯氨酸响应的转录-蛋白质组学联合分析

赵卫松，郭庆港，董丽红，王培培，苏振贺，张晓云，鹿秀云，李社增，马平

河北省农林科学院植物保护研究所/河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心/农业农村部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室，河北保定 071000

【】棉花根系分泌物L-脯氨酸是影响生防菌株定殖的关键因素之一，前期研究发现L-脯氨酸能够提高枯草芽孢杆菌（）NCD-2生物膜形成能力。通过高通量测序技术分析L-脯氨酸调控枯草芽孢杆菌NCD-2生物膜形成和生防潜力相关的基因，为深入认识棉花根系分泌物与生防菌株的分子互作关系打下基础。以枯草芽孢杆菌NCD-2菌株为供试材料，外源添加浓度为10 mg·mL-1的L-脯氨酸共培养24 h后，分别进行转录组（RNA-seq）和同位素标记相对定量蛋白质组技术（iTRAQ）分析，对所获得的转录组和蛋白质组数据进行生物信息学分析，利用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）验证不同代谢通路中部分差异基因的表达情况。转录组分析发现，L-脯氨酸和NCD-2菌株共培养后，获得1 071个差异表达基因（DEG），其中602个基因上调，469个基因下调。GO分析发现在生物过程、细胞组分和分子功能方面分别有49、14和30个功能条目显著富集。KEGG代谢通路主要富集在化合物代谢、鞭毛组装、细菌运动和趋化作用。蛋白质组学分析发现，筛选到211个差异表达蛋白（DEP），其中118个蛋白上调，93个蛋白下调。GO分析发现在生物过程和分子功能方面分别有13和8个功能条目显著富集。……