唐振双, 殷东, 尹立林, 马云龙, 项韬, 朱猛进, 余梅, 刘小磊, 李新云, 邱小田, 赵书红

猪基因组选择“两步走”策略的计算机模拟评估

唐振双1, 殷东1, 尹立林1, 马云龙1, 项韬1, 朱猛进1, 余梅1, 刘小磊1, 李新云1, 邱小田2, 赵书红1

1华中农业大学动物科技学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/农业农村部猪遗传育种重点实验室/国家家畜工程技术研究中心，武汉 430070；2全国畜牧总站 北京 100107

基因组选择育种自2001年被MEUWISSEN等提出以来，已广泛应用在奶牛、猪等重要家畜的育种中，并显著加快了其重要经济性状的遗传改良速度。2017年，在全国畜牧总站的组织协调下，在全国生猪遗传改良计划框架内，猪全基因组选择育种平台项目正式启动。【】尽管基因组选择在种猪选育中取得了良好的效果，基因分型技术的不断升级也带来了成本的持续下降，但对于我国多数核心育种场依然面临着基因芯片分型个体数量不足、基因组选择实施流程不完善等问题，限制了该技术的大规模推广应用。结合我国生猪育种的实际情况，研究提出了一种“终测选择-早期选择”的“两步走”基因组选择策略。“终测选择”指在终测结束后利用一步法基因组BLUP对后备猪进行遗传评估，当群体中芯片分型个体数量达到一定规模后进行“早期选择”。以杜洛克、长白和大白三个种猪品种真实的50K基因芯片数据作为基础群体对不同品种分别进行大群模拟，共模拟4个世代，前3个世代作为基础群体，第4个……