崔欢 高巧丽 罗立新 杨靖 陈淳 郭涛 刘永柱 黄永相 王慧 陈志强,* 肖武名,*

水稻萌发期激素信号转导和谷胱甘肽代谢转录分析

崔欢1高巧丽1罗立新1杨靖1陈淳1郭涛1刘永柱1黄永相2王慧1陈志强1,*肖武名1,*

(1华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心，广州 510642；2广东海洋大学 滨海农业学院，广东 湛江 524088；*通信联系人，E-mail：chenlin@scau.edu.cn；heredity24@126.com）

【】利用转录组测序技术，探究水稻萌发过程中激素信号转导和细胞内部氧化还原平衡的调控机理，以期增加对萌发过程中复杂调控机制的理解，促进萌发期基因组转录调控网络的构建，并挖掘调控种子萌发的相关基因，为水稻直播稻新品种选育提供理论参考。利用萌发0、24和48 h的种子进行动态转录组测序分析，以差异倍数≥2、错误发现率≤0.05为阈值筛选差异基因，并利用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway数据库对萌发不同阶段的差异基因进行分析注释；同时利用实时荧光定量PCR对测序结果进行验证；最后运用String蛋白互作数据库以combined_score≥0.9为阈值分析差异基因的蛋白互作网络。在种子萌发前期鉴定到8719个差异基因，而在萌发后期仅鉴定到3480个。GO和KEGG富集结果均显示与激素信号转导相关的基因主要在萌发前期被诱导，特别是生长素信号转导途径中的GH3家族基因在萌发前期均受到显著诱导；而谷胱甘肽代谢途径中的基因在萌发后期转录更为活跃，其中谷胱甘肽-S-转移酶基因富集最多。此外，两个异柠檬酸脱氢酶基因在萌发过程中被显著诱导，经蛋白互作预测发现两个异柠檬酸脱氢酶基因与GH3家族基因可能存在相互作用。……