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利用全基因组关联分析挖掘粳稻直链淀粉含量调控基因

2021-11-16郑洪亮孙世臣丁国华王彤彤赵宏伟王敬国刘化龙邹德堂来永才

东北农业大学学报 2021年10期
关键词:分析

郑洪亮,孙世臣,丁国华,王彤彤,赵宏伟,王敬国,刘化龙,韩 笑,邹德堂,来永才

(1.黑龙江省农业科学院博士后科研工作站,哈尔滨 150086;2.东北农业大学寒地粮食作物种质创新与生理生态教育部重点实验室,哈尔滨 150030;3.黑龙江省农业科学院,哈尔滨 150086)

淀粉作为稻米主要成分,占稻米干重90%左右,其组分主要包括直链淀粉和支链淀粉,其中直链淀粉含量是影响水稻蒸煮食味品质重要因素,研究认为稻米直链淀粉含量、结构和组成影响胶稠度、糊化温度[1],且稻米蒸煮食味与直链淀粉含量呈显著负相关,与胶稠度呈显著正相关[2]。因此,挖掘稻米直链淀粉含量QTLs/基因,对于改良稻米品质具有重要意义。

稻米直链淀粉含量是由多基因控制的数量性状,利用正向遗传学和反向遗传学方法挖掘到与直链淀粉含量相关QTLs/基因。目前,已利用传统QTL分析方法从32个遗传群体中定位直链淀粉含量相关QTL 141个[3],但由于不同研究人员采用试验材料遗传背景差异较大,且选用分子标记不同,导致定位结果差异较大。李修平等进一步采用元分析方法对141个QTL构建一致性图谱,最终映射得到30个“一致性”QTL[3]。目前,已克隆水稻直链淀粉相关基因11个,包括位于第6染色体上的颗粒结合型淀粉合成酶基因Wx,也是公认的水稻直链淀粉含量主效基因[4],位于第6和第8染色体上与可溶性淀粉合成酶相关的3个基因SSSI[5]、SSIIa[6]和SSIIIa[7],位于第1、3、5、7、8、9染色体上与ADP葡萄糖焦磷酸化酶相关的6个基因[8]:AGPL1、AGPL2、AGPL3、AGPL4、AGPS1、AGPS2a,以及位于第2染色体上与淀粉分支酶相关的基因SBEIIb[9]。……

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