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应用Illumina MiSeq测序技术对腹泻北平顶猴肠道菌群的分析

2021-11-14张飞燕张庆宇吕龙宝

野生动物学报 2021年4期

金 洁 张飞燕 张庆宇 王 芸 吕龙宝*

(1.中国科学院昆明动物研究所,昆明,650223;2.国家非人灵长类实验动物资源库,昆明,650223)

平顶猴(Macaca)是旧大陆猴中唯一易感艾滋病毒1型(HIV-1)的灵长类(Primates)动物[1],其生理结构、机体代谢等方面与人类极为相似,是研究艾滋病病毒、新药临床前试验和安全评价的理想动物模型[2-3]。此外,由于平顶猴具有复杂而精细的神经活动和行为,也常常用于研究脑结构和功能。根据所在地域,平顶猴被划分为3个种:南平顶猴(M.nemestrina)、北平顶猴(M.leonina)和明打威猴(M.pagensis),其中分布在中国的平顶猴被称为北平顶猴[4]。2012年,中国科学院昆明动物研究所在国内率先建成北平顶猴饲养繁殖基地,通过长期的临床病例统计分析发现,在北平顶猴消化道疾病中腹泻的发病率较高,约占10%,严重者可出现脱水,甚至休克。据报道,在临床上能引起腹泻的病因非常多且复杂,如:肠源性疾病[5]、内分泌疾病[6]、肿瘤[7]和抗生素[8]等,其共同的临床症状均包括肠道菌群失调。在健康动物体内,肠道菌群处于动态平衡中,与宿主协同进化互利共生,对维持宿主健康具有重要意义。当这种平衡被打破时,如:益生菌丰度减少、有害菌丰度大量繁殖,会造成各种炎症、肠胃疾病等,常出现腹泻症状。菌群失调可能是引起疾病的原因,或是疾病导致的结果。目前,对北平顶猴肠道菌群的研究尚未有报道。为了探究北平顶猴的肠道菌群结构及其腹泻过程中肠道菌群的失调规律,本研究对健康和腹泻北平顶猴的肠道菌群进行了对比分析,结合肠道微生态平衡的机理,揭示可能导致腹泻的菌群及其变化规律,为平顶猴腹泻治疗用药和益生菌制剂的合理使用提供科学依据。……

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