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CRISPR-Cas系统在核酸检测中的应用研究

2021-11-06胡秀文刘华王宇唐雪明王金斌曾海娟蒋玮李红

生物技术通报 2021年9期
关键词:检测方法系统

胡秀文 刘华 王宇 唐雪明,5 王金斌 曾海娟 蒋玮 李红

(1. 上海海洋大学食品学院,上海 201306;2. 上海农业科学院生物技术研究所,上海 201106;3. 兰州理工大学生命科学与工程学院,兰州730050;4. 上海市农业遗传育种重点实验室,上海 201106;5. 上海交通大学农业与生物学院,200240;6. 上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海 201106)

核酸检测技术在诊断感染、遗传疾病和癌症方面具有至关重要的作用,因此核酸检测技术得到了快速发展[1]。其中几种主要以PCR为基础的核酸检测技术已被用于病原体检测[2],但需要昂贵的试剂和设备,以及熟练的人员。恒温扩增方法也被应用到核酸检测方面[3],由于设备和应用技术的制约等因素,阻碍了核酸检测的现场速测应用[4]。因此开发灵敏、快速和特定的传感工具对于诊断检测至关重要。而目前发现的CRISPR-Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)系统基于其准确识别和切割特定DNA和RNA序列的能力,已被用于基因组编辑[5-6],展示了其强大的分子检测潜在能力,成为了开发新的检测平台的热点。

CRISPR系统是细菌及古细菌利用Cas效应蛋白在crRNA引导下抵御外源核酸入侵的一种获得性免疫防御系统。研究人员在大肠杆菌基因组中发现具有重复DNA序列的的遗传结构,该结构是由CRISPR基因座,DNA靶向间隔序列以及编码crRNA(crispr RNA)组分和Cas蛋白操纵子的组分构成,称之为CRISPR-Cas系统[7]。它能将入侵的噬菌体、质粒和转座子的移动遗传元件(MGES)作为自己的间隔区序列,构成了细菌和古细菌适应性和遗传免疫的基础[8]。在自然条件下的CRISPR-Cas系统中,包括Cas12[9]、Cas13[10]和Cas14[11]及其同源物,会表现出间接的非特异性催化活性,可用于核酸检测,例如通过降解标记的核酸产生荧光信号[12]。……

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