基于网络药理学牛磺石胆酸抗炎作用及机制
2021-11-04王妙然张芸绮蔺晓菁陈春秀肖晓秋李继斌
王妙然,李 月,张芸绮,蔺晓菁,钟 莹,陈春秀,周 永,肖晓秋,李继斌
(1.重庆医科大学营养与食品卫生学教研室,2.重庆医科大学附属第一医院重大代谢性疾病转化医学重庆市重点实验室,重庆 400016;3.重庆市巴南区人民医院临床营养科,重庆 401320)
动物胆汁及其结石是一种沿用数千年的传统中药原料,可用于治疗肝胆疾病、惊厥、创伤和皮肤溃疡、感染性疾病等。其主要成分包括胆汁酸、胆色素、胆固醇、磷脂及抗氧化物(如维生素E,褪黑素,谷胱甘肽等)。胆汁酸是胆汁的主要成分,由胆固醇在肝脏中合成,储存于胆囊,并随进食活动分泌到肠道。除了能促进脂类和脂溶性维生素吸收,还可作为调节代谢、炎症和免疫功能的生物信号分子[1-2]。牛胆汁和牛胆结石(牛黄)因其来源丰富而被广泛使用。牛胆汁中包含的胆汁酸主要有TCA、TDCA、TCDCA、TLCA、GCA、GDCA、GCDCA、GLCA、ACA等[3]。其中,牛磺石胆酸(taurolithocholic acid,TLCA)是由CDCA衍生而来的一种典型的次级胆汁酸,也存在于人类胆汁中,具有抑制炎症反应的作用[4],但其具体机制尚未完全明确。近年来,网络药理学方法越来越多地用于中药复方或单体成分作用靶点的分析预测[5],具有系统性解释药物治疗疾病作用机制的优点。因此,本文利用网络药理学来研究TLCA的抗炎作用及机制。
1 资料与方法
1.1 TLCA分子结构与作用靶标获取查询PubChem数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/chemicals/)并下载TLCA的3D分子结构。将文件导入PharmMapper Service数据库(http://www.lilabecust.cn/pharmmapper/)和SWISS数据库(http://swisstargetprediction.ch/)获得TLCA潜在作用靶点,利用UniProt数据库的Retrieve/ID Mapping功能,将靶点UniProt ID转换为Gene Symbol。
1.2 炎症靶点筛选在GeneCards数据库中(https://www.genecards.org/)检索获取炎症相关基因,分别与TLCA作用靶点进行匹配,得到共同靶点。……
