基于有限突变模型和大规模数据的19个常染色体STR的实际突变率研究
2021-11-01刘志勇任贺陈冲张京晶张晓梦石妍石林玉陈滢程凤贾莉陈曼范庆炜张家榕李万婷王萌春任子林刘雅诚倪铭孙宏钰严江伟
刘志勇,任贺,陈冲,张京晶,张晓梦,石妍,石林玉,陈滢,程凤,贾莉,陈曼,范庆炜,张家榕,李万婷,王萌春,任子林,刘雅诚,倪铭,孙宏钰,严江伟
研究报告
基于有限突变模型和大规模数据的19个常染色体STR的实际突变率研究
刘志勇2,任贺3,陈冲4,张京晶5,张晓梦1,石妍4,石林玉1,陈滢4,程凤1,贾莉4,陈曼6,范庆炜7,张家榕1,李万婷1,王萌春1,任子林8,刘雅诚4,倪铭8,孙宏钰2,严江伟1
1.山西医科大学法医学院,太原 030001 2.中山大学中山医学院法医学系,广州 510080 3.北京警察学院,北京 102202 4.北京通达首诚司法鉴定所,北京 100192 5.北京华彦科技有限公司司法鉴定所,北京 100192 6.南方医科大学法医学院,广州 510515 7.川北医学院法医学系,南充 637000 8.北京辐射医学研究所,北京 100850
短串联重复序列(short tandem repeat, STR)已广泛用于法医学亲子鉴定和个体识别中,但STR的突变可能会影响其结果的解释。在大多数类似研究中,由于忽略“隐性”突变现象,STR的突变率被低估。鉴于此,为获得更加准确的STR实际突变率,本研究使用Slooten与Ricciardi提出的有限突变模型和大规模数据,对28,313例(78,739个体)中国北京汉族已确认亲生关系的亲子鉴定案的20个常染色体STR基因座(和;由于有限突变模型中未包含的矫正参数,因此本文实际计算其余19个STR基因座的突变率)进行了调查。结果发现,所有基因座均存在突变现象,总计发生1665个突变事件,包括1614个一步突变,34个两步突变,8个三步突变和9个非整步突变。基因座特异性的平均实际突变率在三联体中为0.00007700 ()~0.00459050 (),在二联体中为0.00000000 ()~0.00344850()。此外,本研究还分析了表面和实际突变率、三联体和二联体突变率、父源和母源的突变率之间的关系。……
