基于小RNA技术的天津地区番茄花叶病毒分子检测与基因组部分序列分析
2021-11-01金凤媚孙海波郝志愚
金凤媚,薛 俊,孙海波,郝志愚
(天津市农业科学院,天津 300192)
番茄(LycopersiconesculentumMill.)在我国种植面积较大,在保证蔬菜供应上占有重要地位。近年来,在番茄产区,番茄病毒病发生严重,在天津地区发生的主要病毒病有番茄黄化曲叶病毒(Tomatoyellowleafcurlvirus,TYLCV)、番茄褪绿病毒(Tomatochlorosisvirus,ToCV)、番茄斑萎病毒(Tomatospottedwildvirus,TSWV)、黄瓜花叶病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)、番茄花叶病毒(Tomatomosaicvirus,ToMV)等[1-3]。
ToMV为正义单链RNA病毒,属于帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)。基因组共有4个开放阅读框,分别编码外壳蛋白(Coat Protein,CP)、运动蛋白(Movement Protein,MP)以及与复制相关的126 ku蛋白和183 ku蛋白[4]。由于ToMV与烟草花叶病毒(Tobaccomosaicvirus,TMV)亲缘关系很近,所以在早期报道中,将ToMV称为TMV番茄分离物[5]。近年来,鉴于ToMV和TMV在生物学、血清学和核酸序列等方面的不同,ToMV被作为一种独立的病毒进行研究[6]。ToMV的寄主很多,番茄是该病的主要寄主。ToMV侵染番茄后叶片出现花叶病状,有的还会导致叶片变形,植株矮缩,甚至死亡。果实会出现着色不均,或出现凹陷的褐色病斑[7]。
近年来,天津市西青区和宝坻区的部分番茄产区陆续发现了疑似番茄花叶病毒引起的酱油果。由于其表现非常类似于由低温引起的番茄转色不良而产生的酱油果,导致很多农户错误地采取喷施营养肥和提高棚室地温的措施,病株也未见明显好转,严重影响了番茄果实的品质和产量。因此,明确这种番茄病的病原已迫在眉睫。
本研究利用小RNA 深度测序及RT-PCR 技术对天津地区番茄病株样本进行了病原的分子鉴定及基因组序列分析,旨在明确引起该病的病原,同时为该病的预防和治疗提供理论依据。……
