双乾肉羊全基因组SNP/InDel分析及毛色相关候选基因鉴定
2021-10-30刘正喜胡明月白春艳赵中利马惠海闫守庆吉林大学动物科学学院吉林长春3006吉林省农业科学院畜牧兽医研究所吉林公主岭3600
刘正喜,武 斌,胡明月,白春艳,赵中利,曹 阳,马惠海*,闫守庆* (.吉林大学 动物科学学院,吉林 长春 3006;.吉林省农业科学院 畜牧兽医研究所,吉林 公主岭 3600)
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指在DNA水平上因单个核苷酸的替换、插入或缺失导致的核酸序列多态性[1]。插入/缺失多态性(insertion/deletion,InDel)是指基因组中某个等位基因座位上因插入或缺失了小片段 DNA所产生的多态性[2]。与其他种类的分子遗传标记相比,SNP和InDel标记具有在基因组中分布广泛、稳定性好和检测易自动化和规模化等优势。随着2代测序技术的快速发展和测序价格的下降,SNP和InDel分子标记已在大量非模式生物中被广泛挖掘,并广泛应用于遗传图谱构建[3]、重要经济性状主效基因定位[4-5]、种属鉴定[6]、个体识别[7]、生物群体遗传结构以及系统发育分析等方面[8-9]。
绵羊属洞角科(Bovidae)绵羊属(Ovis)动物,是人类最早被驯化的家养动物之一,可为人类提供食物和附属品(肉、毛、皮和奶等)[10]。近年来,国内羊肉产品消费需求急剧增长,但是目前在我国肉羊产业发展中,引进品种的繁殖力低和地方品种的生长速度慢是制约肉羊生产的两个主要问题,因此生长速度快且繁殖力高的肉用绵羊新品种或品系的培育势在必行[11]。
双乾肉羊是吉林省农业科学院利用杜泊羊为父本、吉林省本地绵羊为母本,通过杂交、回交以及横交固定等常规育种手段结合分子标记辅助选择方法,选育出的具有采食性好、生长速度快和产仔数高等种质特性的肉用羊新种群。……
