APP下载

一种可视化双重荧光RT-LAMP方法鉴别不同毒力新城疫病毒

2021-10-30曾婷婷谢丽基谢芝勋罗思思黄娇玲张民秀张艳芳邓显文广西壮族自治区兽医研究所广西南宁530001

中国兽医学报 2021年10期
关键词:检测

曾婷婷,谢丽基,谢芝勋,罗思思,李 孟,黄娇玲,张民秀,张艳芳,范 晴,邓显文 (广西壮族自治区兽医研究所,广西 南宁 530001)

新城疫(Newcastle disease,ND)是由中等毒力或强毒力的新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)引起的高传染性、高致病性和高致死性的传染病。NDV可以感染超过250种禽类和鸟类[1],根据全基因组遗传进化分析,NDV被划分为ClassⅠ和ClassⅡ两大分支[2],目前引起发病的NDV绝大多数是ClassⅡNDV。世界动物卫生组织(OIE)根据NDV的3个致病指数,将NDV划分为速发型、中发型和缓发型毒株[3],即通俗称的强毒、中等毒和弱毒。决定NDV毒力的主要基础是F蛋白的前体F0蛋白能否被宿主蛋白酶裂解,所以F0蛋白裂解位点所对应的核苷酸序列可作为判断NDV毒力的分子标志[3]。目前,已有研究者建立了针对这个位点的不同的分子生物学鉴别检测方法,如RT-PCR[4]及qRT-PCR方法[5]等。环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是NOTOMI等[6]发明的等温扩增技术,具有使用仪器简单、检测结果可视化、反应时间短等优势,在各种疾病检测中得到了广泛的应用。本研究将分子信标引入LAMP反应体系,设计了一套能同时扩增ClassⅡNDV不同基因型F基因的LAMP引物,同时设计2条针对不同毒力NDV F0蛋白裂解位点对应核苷酸序列的分子信标,建立了一套能够通过反应后观测荧光信号判断NDV毒力的双重荧光RT-LAMP检测方法。

1 材料与方法

1.1 病毒株本实验使用病毒株均为本实验室保存,具体见表1。

表1 毒株信息

1.2 主要试剂与仪器EasyPure®Viral DNA/RNA Kit,EasyPure®Quick Gel Extraction Kit,EasyScript®One-Step RT-PCR SuperMix购自北京全式金生物技术有限公司;RT-LAMP试剂盒WarmStart®LAMP Kit (DNA & RNA) 购自美国New England Biolabs(NEB)公司;体外转录试剂盒RiboMAXTMLarge Scale RNA Production Systems购自美国 Promega公司;超微量分光光度计NanoDrop 2000购自美国Thermo Fisher Scientific公司;……

登录APP查看全文

猜你喜欢

检测
QC 检测
小波变换在PCB缺陷检测中的应用