基于网络药理学与分子对接技术探讨补肾活血方治疗多发性骨髓瘤的物质基础与作用机制
2021-10-29周艳群林玲云陈本澍王礼琼刘增慧
周艳群 林玲云 陈本澍 王礼琼 刘增慧
广州中医药大学第一附属医院血液科,广东广州 510405
多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)是常见的恶性浆细胞增殖性疾病,是一种不可治愈的疾病,最终将复发[1]。从中医方面寻求新思路、新方法越发得到重视。MM 属于中医学的“骨痹”范畴[2]。补肾活血方由桃仁、红花、丹参、当归、补骨脂、菟丝子、熟地黄、三七组成,该方是全国名老中医丘和明在多年临床经验中总结出来的,主要用于肾虚血瘀型MM 患者。现代研究发现,补肾活血方在改善MM 患者骨痛症状、增强化疗效果、增强免疫力[3]、保护肾功能[4]、改善骨代谢以护骨[5]等方面均发挥重要作用。基于前期研究基础上,本研究运用网络药理学与分子对接方法,探索补肾活血方治疗MM 的物质基础与作用机制,为后续的临床应用与实验验证提供依据。
1 资料与方法
1.1 补肾活血方的活性成分及靶点挖掘
以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和类药性(drug-likeness,DL)≥0.18 作为潜在活性成分的筛选条件[6],在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中筛选出补肾活血方符合条件的活性成分。在PubChem 数据库中检索并收集每个活性成分的Canonical SMILES 结构式,并分别上传至Swiss Target Prediction 数据库,即可获得与已知配体二维结构相似度精确的预测靶点[7]。
1.2 基因芯片获取
在GEO 数据库中,以“multiple myeloma”作为检索词,筛选出同时含有MM 和正常人骨髓样本的人源基因芯片,文件编号:GSE113295,该芯片由12 例完全缓解MM 骨髓样本和6 例正常样本构成。
1.3 差异表达基因的获取与筛选
采用GEO2R 从基因芯片中筛选MM 患者与正常人骨髓的差异表达基因。……
