2017—2019年四川部分地区PRRSV ORF5基因的遗传演化分析
2021-10-23唐伟明秦立廷董友富张振东
唐伟明,秦立廷,董友富,陈 婷,罗 刚,卞 婷,张振东
(1.江苏科技大学生物技术学院,江苏 镇江 212018;2.山东新希望六和集团有限公司,山东 青岛 266000;3.青岛嘉智生物技术有限公司,山东 青岛 266000)
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的一种急性、热性、高度接触性传染病,临床危害主要表现为母猪繁殖障碍、生长猪呼吸道疾病以及感染猪的继发感染。自20世纪80年代末和90年代初发现PRRSV以来,到目前为止在全球范围内仍未取得实质性的控制,给生猪产业带来了巨大的经济损失[1]。
PRRSV是一种呈球形、有囊膜的单股正链RNA病毒,全长基因组约15 kb,根据国际病毒学分类委员会(International Committee on Taxonomy of Virus,ICTV)最新的分类,其被归为套式病毒目(Nidovirales)、动脉炎病毒科(Arterividae)中的β动脉炎病毒属(Betarterivirus),包括PRRSV1和PRRSV2两个基因型,代表毒株分别为LV和VR-2332[2]。PRRSV具有广泛的变异和毒株多样性,Stadejek等将PRRSV1分为4个亚型[3],Shi等利用ORF5基因进行的遗传演化分析,将PRRSV2划分为9个谱系(Lineage)[4]。目前,我国PRRSV的流行以PRRSV2为主,主要包括4个谱系(Lineage 1,3,5,8)[5-6]。早期流行毒株以CH-1a 为代表的Lineage 8和以BJ-4为代表的Lineage 5为主[7];2006年,我国出现以JXA1和HuN4等为代表的高致病性PRRSV(HP-PRRSV),属于Lineage 8[8];2010年,我国东南部地区出现以QYYZ为代表的Lineage 3毒株[9];2013年,NADC30-like毒株(Lineage 1)传入我国,造成PRRS疫情的新流行[10];近年来,我国PRRSV毒株流行情况愈加复杂,疫苗演化毒株、多谱系重组毒株、新毒株层出不穷[11-12],给我国PRRS的防控带来了巨大的挑战。
本试验对2017—2019年四川部分地区PRRSV阳性样品进行RNA提取,RT-PCR扩增ORF5基因,选取阳性产物进行克隆测序,与PRRSV参考毒株进行比较,以期阐述四川地区PRRSV的流行情况及病毒演化趋势,为PRRS的防控提供参考依据。……
