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人源RNA解旋酶DDX1的表达、究

2021-10-23高宝才段树燕苏晓琴李继喜

复旦学报(自然科学版) 2021年4期
关键词:区域结构分析

高宝才,段树燕,苏晓琴,纪 锐,李继喜

(1. 复旦大学 生命科学学院,上海 200438; 2. 复旦大学 遗传工程国家重点实验室,上海 200438)

RNA解旋酶几乎参与RNA代谢的所有主要步骤,包括pre-mRNA剪切、mRNA转运、RNA编辑和衰减、核糖体合成[1-2].DEAD -box蛋白(DDXs)属于RNA解旋酶超家族II,也是最大的解旋酶家族[3].DDX蛋白包含有9个保守基序,分别命名为Q、Ⅰ、Ⅰa、Ⅰb、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ.其中基序Ⅱ也称为Walker B基序,是以DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)氨基酸序列为特征,并在抗病毒免疫应答和肿瘤发生发展中起着核心作用[4].DDX家族蛋白在发挥解旋酶功能时,ATP与RNA之间存在协同作用[5].目前已知有60余人源DDX蛋白,其中DDX1除了具有共有的解旋酶结构域外,其基序Ⅰ和Ⅰa之间包含一个SPRY结构域,该结构域可介导蛋白质相互作用以及蛋白-RNA相互作用[6].

DDX1最初是在神经母细胞瘤和视网膜母细胞系中发现,并在肿瘤组织中过度表达,因此DDX1被作为乳腺癌的潜在生物标志物和卵巢癌的预测标志物[7].DDX1还参与多种细胞功能,例如mRNA/miRNA加工[8-9],与hnRNP K相互作用[10],参与NF-κB介导的转录[11-12],参与富含AU的元素介导的衰变,以及募集到含有RNA-DNA结构的DNA损伤位点[13-15].此外,DDX1在病毒复制,尤其是在HIV-Rev的复制中发挥重要的作用[16];也可与DDX21、DHX36以及接头蛋白TRIF组成一个巨大复合物,可以感知和识别流感病毒A、呼肠孤病毒以及长短链poly(I: C)信号,激活NF-κB和I型干扰素的表达[17].目前DDX家族中只有少数几个成员,如DDX58(也叫RIG-I)[18]、MDA5[19]和DHX36的结构得以解析[20].我们实验室最近也获得了DDX21识别和解旋底物RNA的多个状态的结构信息,阐明了DDX21识别和结合流感病毒NS1蛋白的作用机理.但目前有关DDX1如何识别、结合……

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