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甜菜品种SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析

2021-10-21丁刘慧子吴则东

作物杂志 2021年5期

丁刘慧子 邳 植 吴则东

(黑龙江大学现代农业与生态环境学院,150080,黑龙江哈尔滨)

随着DNA分子标记技术快速发展,农作物品种鉴定进入了基因水平[6]。较为常见的分子标记技术有 RFLP[7]、RAPD[8]、AFLP[9]、EST[10]、ISSR[11]、SSR[12]、SRAP[13]及 SNP[14]等。SSR,即微卫星序列,是在真核生物中普遍存在的一段由1~6bp组成的重复序列,大约每10~50kb就存在1个微卫星[6],且跨外显子和内含子,具有扩增多态性好、稳定可靠和重复性好等优点,已经被广泛应用于作物品种鉴定、遗传多样性分析和遗传图谱构建等领域。目前,玉米[15]、小麦[16]、马铃薯[17]和菜豆[18]等作物都已经利用SSR标记技术构建了指纹图谱。

近年来,甜菜分子标记发展较快[19],已有研究[20]表明,优化甜菜SSR标记的鉴定体系,开发和筛选出甜菜专有的SSR引物成为甜菜品种鉴定的关键。本研究在前人研究的甜菜SSR分子标记基础上,开发了多对甜菜专用SSR引物,对2017年国家实行品种登记以来至2019年登记的107个甜菜品种进行指纹图谱构建和遗传多样性分析,对参试甜菜品种进行鉴定,为鉴定甜菜种子市场销售中品种的纯度和真伪性提供依据。同时对SSR引物进行多样性评价,筛选出具有高多态性的SSR引物,为甜菜品种鉴定等生物技术方面的研究提供参考。

1 材料与方法

1.1 供试材料

以目前我国市场上已经登记的107个甜菜品种为材料进行指纹图谱数据库的构建。品种详情见表1。

表1 供试甜菜品种及来源Table 1 Tested sugar beet varieties and sources

续表1 Table 1 (continued)

1.2 SSR引物

20对SSR标记引物序列来自黑龙江大学甜菜遗传改良育种重点实验室以及相关文献,或通过EST序列获得[21-23](表2)。……

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