梁小玉, 季 杨, 胡远彬, 易 军, 白史且, 张 靓, 张新全

(1.四川省畜牧科学研究院， 四川 成都 610066； 2. 四川农业大学动物科技学院， 四川 成都 611130；3. 四川省林业和草原局， 四川 成都 610082)

菊苣(Cichoriumintybus)为菊科多年生宿根草本植物，在畜牧业、食品业、医药业以及工业上广泛应用，是当今世界上极具潜力的经济作物之一。目前，国内外对菊苣的研究热点集中在繁育、品种培育、食品营养、化学成分、药理以及牧草等方面[1]，种质资源评价与新品种选育对开发利用菊苣资源越来越重要。但是，缺乏相关菊苣基因组信息，使我们对其遗传信息了解较少，目前所使用的相关序列扩增多态性(Sequence related amplified polymorphism，SRAP)，随机扩增多态性DNA(Random amplified polymorphic DNA，RAPD)，扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism，AFLP)等分子标记也难以满足种质资源评价、后代精准鉴定辅助育种等工作的需要，在一定程度上限制了菊苣种质资源的开发利用。因此，大量开发新的分子标记对于菊苣种质资源辅助育种具有重要的意义。

SSR标记具有共显性遗传、多态性高、易检测、特异性好、通用性高及重复性好等优点，是目前动、植物遗传育种中应用最多的一种分子标记[2-5]，SSR按来源可分为基因组SSR和表达序列标签SSR (EST-SSR)。EST-SSR具有基因组SSR的特征，能够直接获得基因表达的信息，为功能基因提供“绝对”的标记，其多态性可能与基因功能直接相关[6-9]，在近缘物种甚至远缘物种间通用性更好，且开发成本较低[10-13]。本研究基于美国国家生物技术信息中心(National center for biotechnology information，NCBI)数据库公布的菊苣EST序列分析其所含微卫星重复序列的组成……