基于网络药理学探讨马齿苋药理作用的分子机制
2021-09-25张伟
张伟
开封市儿童医院,河南 开封 475000
马齿苋,又名长寿菜,为常见的药食同源的中药,来源广,应用广泛,内服用于治疗痢疾,有降糖、降脂等作用[1],外用可以治疗湿疹、扁平疣和尖锐湿疣等[2-3]。其性寒味酸,入大肠、肝、脾经,有清热解毒、消痈利尿之功效,适用于湿热或热毒所致的痢疾、痈肿和淋症等[4]。有研究表明,其性寒滑利,清血分及大肠热毒,为中医临床治痢疾的常用品,有“痢疾克星”之称[5]。《本草纲目》记载“散血消肿,利肠滑胎,解毒通淋,治产后虚汗”。中药因其成分复杂,靶点众多,应用网络药理学研究中药药理作用的分子作用机制有重要意义。
本研究通过收集整理马齿苋的主要成分和作用靶点,构建成分靶点网络,采用网络药理学的方法分析马齿苋药理作用的分子机制,为寻找马齿苋潜在的药理作用提供了依据。
1 方法
1.1 活性成分及靶标蛋白的筛选通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology data base and analysis platform,TCMSP)[6](http://tcmspw.com/tcmsp.php)检索“马齿苋”。口服生物利用度(oral availability,OB),即口服后药物以原型形式进入血液循环的相对量,是确定药物生物活性,可作为药物的关键指标,筛选值≥30%。类似性(drug-likeness,DL)是基于相似性原理,总体相似的分子应具有相似的生物活性;DL≥0.18,即“类药物”化合物的选择标准。根据活性成分在相关靶点中选出相应的靶点蛋白名称。
1.2 靶蛋白的基因symbol确定及成分-靶基因网络的构建通过UNIPROT[7]数据库(https://www.uniprot.org/)和GENECARDS[8](https://www.genecards.org/)数据库将靶点蛋白转化为相应的gene symbol,采用Cytoscope3.6.0软件构建成分-靶基因网络图。
1.3 构建蛋白相互作用(protein-protein interation,PPI)网络应用STRING[9](https://stringdb.org/)数据库构建相关靶蛋白的PPI网络,并根据度值筛选核心网络作用图。……
