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鸭坦布苏病毒纳米PCR方法的建立及应用

2021-09-24李得鑫李佳暖李富言

今日畜牧兽医 2021年7期
关键词:检测方法

李得鑫,李佳暖,李富言

(1.山东畜牧兽医职业学院 261000;2.山东富言禽病研究院 261100)

鸭坦布苏病主要危害对象是蛋鸭,主要特点是蛋鸭产蛋下降[1]。目前快速诊断该病的方法有PCR、套式RT-PCR、荧光定量RT-PCR、RT-LAMP等方法。这些方法的优点很明显,检测快速,敏感性更高,但是荧光定量PCR所需的仪器很昂贵,LAMP对环境要求很严格,容易形成气溶胶。由于这些缺点,导致这些方法在临床应用时很受局限[2]。为了改善这种情况,本研究针对鸭坦布苏E基因,建立了一种快速、灵敏、特异的纳米PCR 检测技术。

1 材料

1.1 病原

实验室分离的鸭坦布苏病毒(DTMUV)、鸭病毒性肝炎(DHV)、鸭瘟(DPV)、鸭病毒性肠炎(DEV)毒株。

1.2 试剂

由全式金(北京生物科技有限公司)生产的Mark2K,Nano试剂盒。

2 方法

2.1 引物设计

以GeneBank:KC136210.1 E基因为模板,应用primer5软件设计扩增DTMUV的E基因的348bp目的片段的引物。引物由瑞普公司合成。

表1 引物信息

2.2 RNA的提取

250μL病毒与750uL Transzol混合,强烈振荡5min,静置5min;加250μL氯仿,剧烈振荡1min,静置5min,4℃,12000r/min, 15min离心;吸取上层液体600μL于EP管中,加等量异丙醇,混匀后,室温静置15min, 4℃, 12000r/min, 15min离心; 弃上清加900μL DEPC水酒精,4℃,12000r/min, 8min;弃上清,离心12000r/min, 3min; 利用移液枪枪吸取剩余上清液,超真空干燥;最后加上9.5μL溶解液。

反应条件优化 DTMUV最佳的纳米PCR反应体系为:2×Nano Buffer12.5μL,F1为0.5μL,R1为0.5μL,cDNA为1μL,ddH2O为10μL,Tap酶为0.5μL;最佳PCR反应条件为94℃ 3min;94℃ 30s,55℃ 30s,72℃ 21s, 30个循环;72℃5min。

敏感性的检测 模板浓度经检测为3.7ng/μL,为得到浓度梯度标准品,将模板用溶解液按10倍倍比稀释溶解,分别利用纳米PCR和普通PCR这两种方法对稀释后的模板进行扩增,比较二者的敏感性。

特异性的检测 利用设计的引物对DTMUV、DHV、DPV、DEV进行特异性检测。

3 结果

3.1 从电泳图1可以看出,DTMUV的348bp的目的片段被成功检出。……

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