非洲猪瘟病毒复制相关基因E165R启动子预测及其甲基化分析
2021-09-22张彦兵张石磊刘良波谢全亮孙延鸣
张彦兵 张石磊 刘良波 谢全亮 孙延鸣*
(1石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832003;2石河子大学生命科学学院,新疆石河子 832003)
非洲猪瘟(African Swine Fever,ASF)自从 2018年秋季传入我国,迅速在我国各地区猪场点状散发,给我国的养猪业造成了严重的损失。非洲猪瘟病毒感染猪体,会造成猪体皮肤发红、发绀,出现皮炎,强毒感染可导致猪多个脏器出血,例如,脾脏、肾脏等出血,对猪体造成严重的病理损伤。非洲猪瘟病毒(African Swine Fever Virus,ASFV)感染的靶细胞主要是猪原代肺泡巨噬细胞、树突状细胞以及骨髓细胞等[1]。
ASFV作为一类DNA病毒,基因组大小为170~190 kb,两端为可变区域,中间为保守的核心区域;由于两端高度可变使得ASFV具有较多的基因型[2]。ASFV有多层外膜包裹着病毒核酸,因此该病毒具有较强的耐受性,对酸碱不敏感;在潮湿的条件下,ASFV在猪肉中存活数年之久[3]。ASFV的灭活疫苗不能提供免疫保护,基因缺失疫苗仍然具有一定的毒力,甚至可导致猪只死亡[4]。到目前为止,仍然没有安全有效的ASF疫苗用于猪群的免疫保护。目前,为了防控ASFV的传播,主要采取生物安全防控措施来遏制病毒。
一般DNA甲基化发生在基因序列的cg位点,cg位点又称CpG位点,其甲基化主要由DNA甲基化转移酶(DNMTs)调控,哺乳动物DNA甲基化转移酶主要包括DNMT3B、DNMT3A和DNMT1,基因启动子区域高甲基化抑制基因表达,启动子区域低甲基化则利于基因转录表达[5]。ASFV复制过程中完全借助宿主细胞进行自我复制,宿主细胞自身DNA甲基化修饰是否参与限制病毒基因复制的过程,从而抑制ASFV的复制,还不清楚。……
