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基于CRISPR/Cas系统的分子诊断技术原理及应用研究进展

2021-09-15刘晓静原志伟刘振波

质量安全与检验检测 2021年3期
关键词:检测系统

刘晓静 原志伟 刘振波

(1.中华人民共和国荣成海关 山东荣成 264300;2.中华人民共和国威海海关)

1 前言

自2012年以来,科研人员常用CRISPR技术对生物的DNA序列进行敲除、突变、替换或添加,CRISPR技术用于基因编辑具有成本低廉、构建简单、操作方便、适用广泛等特点,因此研究人员称之为“基因魔剪”,该项技术也因此获2020年度的诺贝尔化学奖,这一革命性的发现为整个生物技术领域提供了无限可能。自2017年以来,CRISPR技术在分子诊断领域迅速崛起,并具有快速、准确、经济、设备依赖性低的优势[1]。

目前基于CRISPR/Cas系统的核酸分子诊断方法种类繁多,根据CRISPR诊断背后的Cas蛋白的不同,本文综述了4种具有代表性的Cas蛋白核酸分子诊断技术原理及应用研究进展。随着CRISPR技术的不断发展完善,该技术必将给病原体快速诊断带来重大变革。

2 CRISPR/Cas系统简介

2.1 CRISPR/Cas系统的基本结构

CRISPR/Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,是抵抗外源遗传物质(如噬菌体和质粒)侵入的获得性免疫系统。成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR,Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)和CRISPR关联蛋白(CRISPR associated proteins)共同简称为CRISPR/Cas系统。图1展示了完整的CRISPR/Cas系统基本结构组成。其中,CRISPR序列由众多短而保守的重复序列区(repeat)和间隔区(spacer)组成。而在上游的前导区(leader)被认为是CRISPR序列的启动子。

图1 CRISPR/Cas系统基本结构组成

另外,在上游还有一个多态性的家族基因,该基因编码的蛋白均可与CRISPR序列区域共同发生作用,因此该基因被命名为Cas基因。tracrRNA的全称是trans—activating crRNA(反式激活crRNA),位于Cas基因以及前导序列-重复-间隔序列的反方向,介导非编码前体crRNA(pre-crRNA)的成熟以获得crRNA(CRISPR RNA),也被称为向导RNA(guide RNA,gRNA)[2]。……

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