陈建军 赵怡迪 曹香林

（1. 河南师范大学生命科学学院，新乡 453007；2. 河南师范大学水产学院，新乡 453007）

鲤是中国最重要的淡水鱼之一，营养丰富，肉质鲜美［1］。在水质恶化、饲料变质等情况下，以鲤为代表的吃食性鱼类易引发细菌性肠道疾病，从而阻碍了水产养殖业的可持续发展［2-3］。脂多糖（lipopolysaccharide，LPS）是革兰氏阴性细菌细胞壁外膜结构的重要组成成分，因其是革兰氏阴性细菌的主要毒力因子，常用于致病机制的研究［4］。肠上皮细胞（intestinal epithelial cells，IEC）是肠道内外环境的媒介，又是机体免疫屏障的重要组成部分［5］。在开展环境细菌对鱼类肠道毒理学机理研究中，采用活体暴露方式，往往由于实验动物的个体差异，造成误差和不确切的结果［6］。因此，采用鲤肠上皮细胞培养方法，利用离体细胞开展机理研究更为 理想［7］。

转录组测序（RNA-seq）技术作为一种高效、快捷的转录组研究方法［8］，能够反映细胞在某一特定环境和时间的基因表达情况，通过差异基因的表达分析和功能富集分析，挖掘功能基因［9］。吕钧惠等通过RNA-seq技术分析研究中国青鳉原代肝细胞中雌激素响应基因，并筛选出了105个显著差异基因（37个上调，68个下调）［10］。岳影星等［11］采用RNA-seq技术对脂多糖处理大鼠心脏微血管内皮细胞进行了转录组学分析，GO和KEGG富集的结果表明，上调基因与内皮细胞对炎性免疫细胞的趋化作用和黏附作用密切相关；而下调基因则是与钙离子信号和G蛋白相关通路以及内皮通透性增加有关。

本研究以鲤肠上皮细胞为实验对象，经脂多糖暴露24 h后，利用RNA-seq技术获得转录本后，通过差异基因的表达分析和功能富集分析，揭示脂多糖调控鲤肠上皮细胞差异基因的功能和通路。……