王智博 王道平 苗兰 李瑛 潘映红 刘建勋

（1. 中国中医科学院西苑医院基础医学研究所，北京 100091；2. 中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081；3. 北京市中药药理学重点实验室，北京 100091）

蛋白质组学技术作为基因组学和转录组学的补充，可用于基因组所表达蛋白的定性定量［1］，在发现疾病潜在蛋白分子标志物和药物靶点以及探究蛋白作用机制等领域具有广阔的应用前景。蛋白质组学常以细胞、组织和血液为研究材料，其中血液样本因其微创易得且更能反应生物体的综合状态，目前广泛用于相关研究中［2-4］。

蛋白质组学研究的实验流程主要由样本制备、质谱分析、数据处理和生物信息学分析等环节构成。在这些研究环节中，属于样本制备范畴的预处理和酶切技术可显著影响蛋白鉴定率和数据重复性等后续质谱分析结果［5］。尽管当前应用广泛的超滤法样本制备技术简化了溶液内酶切的浓缩和除盐步骤，能减少样本损失，获得较高纯度肽段［6］，血液样本的预处理和酶切技术仍需进一步完善。

血液样品的复杂构成特别是高丰度蛋白是影响蛋白质组学分析效果的主要因素［7］。研究表明基于抗体的亲和色谱吸附可有效去除血样中的高丰度蛋白［8］。基于不同的研究目的，血液样品可分成血清和血浆，其中血清在制备过程中已去除大部分纤维蛋白原，常用于蛋白质组学分析［9］。酶切技术在血液样本制备中的重要性也不容忽视。酶切前通常进行蛋白质变性处理，其中热变性较化学变性与质谱兼容性高，操作简便且不引入外来干扰物，可作为化学变性的替代方法［10］。……