APP下载

蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)全长转录组测序及 分析

2021-09-14尚骁尧周玲芳尹芊芊晁跃辉

生物技术通报 2021年8期
关键词:融合分析

尚骁尧 周玲芳 尹芊芊 晁跃辉

(北京林业大学草业与草原学院,北京 100083)

蒺藜苜蓿是一种非常重要的豆科模式植物,其具有基因组小,自花授粉,生命周期短,结实率高,具有稳定的遗传转化体系,越来越受到科研工作者的青睐。蒺藜苜蓿有2个品种已经被测序成功,其中,A17最早于2011年测序完成,目前已经更新至4.0版本[1-2];另一个品种为R108,与A17相比,具有更高的遗传转化率,更短的生命周期,种子更易萌发,而且目前世界上最大的蒺藜苜蓿突变体库就是使用的R108,所以被广泛应用于基因功能研究,基于以上优点,R108蒺藜苜蓿于2014年被测序成功,并于2017年12月进行了版本更新[3-4]。

二代高通量测序(next-generation high-throughput sequencing,NGS)技术的出现,使高通量测序的成本有了大幅度的降低,使得转录组分析变得更加便捷。通过该技术,在蒺藜苜蓿中已经开展了大量的工作。通过NGS技术,分析一个MtTdp1α缺失的蒺藜苜蓿突变体,结果显示该突变体中与DNA修复,DNA损伤以及染色体重组相关的基因转录水平发生了显著的变化[5]。通过NGS技术分析蒺藜苜蓿根瘤的发生过程,鉴定出1 140个差异表达基因,其中很多涉及磷转移的基因表达水平明显上调;大量涉及根瘤形成的基因表达水平显著上调,而抑制根瘤形成的基因表达水平下调[6]。利用该技术,在蒺藜苜蓿长期添加细胞分裂素及细胞分裂素抑制剂的过程中,鉴定出大量与蒺藜苜蓿响应细胞分裂素相关的基因,这些基因为研究蒺藜苜蓿生长发育和激素调节提供了候选[7]。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

融合分析
村企党建联建融合共赢
融合菜
从创新出发,与高考数列相遇、融合
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
宽窄融合便携箱IPFS500
《融合》
电力系统不平衡分析
电力系统及其自动化发展趋势分析
中西医结合治疗抑郁症100例分析
在线教育与MOOC的比较分析