非小细胞肺癌中免疫相关基因的预后作用
2021-09-13崔笑廖正凯
中国医药生物技术 2021年4期
崔笑,廖正凯
·论著·
非小细胞肺癌中免疫相关基因的预后作用
崔笑,廖正凯
430071 湖北,武汉大学中南医院肿瘤放化疗科
构建非小细胞肺癌免疫基因预后模型,验证其与预后的相关性。通过 ssGSEA 对 TCGA 数据库中非小细胞肺癌样本进行免疫细胞浸润相关性的分析,将肿瘤样本分为高免疫组和低免疫细胞浸润组,并经过 ESTIMATE 算法、免疫基因相关性分析及 CIBERSORT 算法进一步验证分组效果。使用 R 软件“limma”包筛选高、低免疫组及癌和癌旁各自的差异基因,取交集基因进行功能聚类分析。应用单因素 Cox 回归分析与预后相关的基因,通过 Lasso 回归和多因素 Cox 回归分析构建预后模型,并使用 Kaplan-Meier 验证模型与患者生存的预后相关性。单因素 Cox 分析和多因素 Cox 分析验证了免疫基因预后相关模型为独立预后因素,ROC 分析进一步验证其对生存预测的准确性。根据转录组测序结果将所有样本分为高免疫细胞浸润组和低免疫细胞浸润组,不同组别间 HLA 家族基因和 PD-L1 表达量有显著差异。对筛选出的免疫相关差异基因进行蛋白互作网络分析和细胞功能聚类分析,并构建免疫基因预后模型。Kaplan-Meier 验证了该模型与患者生存具有预后相关性。ROC 曲线验证该模型为预后相关因素。非小细胞肺癌中差异表达基因与免疫相关基因的交集可用于构建免疫预后模型,确认其具有免疫预后功能。
非小细胞肺癌; TCGA 数据库;免疫相关基因;预后模型
肺癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,而且具有高度的侵袭性。……
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