多孢木霉HZ-31菌株胁迫下野燕麦内参基因的选择
2021-09-07朱海霞
朱海霞
(1. 青海大学农林科学院, 青海 西宁 810016; 2. 农业部西宁作物有害生物科学观测实验站, 青海 西宁 810016;3. 青海省农业有害生物综合治理重点实验室, 青海 西宁 810016)
杂草对环境压力的响应是由基因表达调节介导的。在现代农业体系中,杂草入侵农田面临的主要胁迫是除草剂的应用,它触发了杂草植物的胁迫响应途径[1]。研究这种现象背后的分子机制,并为理解基因的生物学功能提供依据,需要分析植物胁迫响应途径中基因的表达模式。基因表达模式反映了基因活动的趋势,对基因功能和基因调控网络的深入了解具有重要意义[2-3]。实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-qPCR)是基因表达分析中广泛使用的技术之一,它提供了比较不同组织和处理中靶基因表达水平的手段,使研究人员能够进行基因定量分析,还可以验证高通量基因表达谱[4]。利用RT-qPCR方法在给定的实验体系中获得可靠的基因表达模式,必须消除或降低由于模板的数量和质量、RNA提取量、cDNA合成效率和qPCR扩增本身所引起的技术差异[5]。目前,RT-qPCR数据的标准化优先使用内参基因作为内部对照进行[6]。由于参与细胞存活所必需的生理生化过程,持家基因(House-keeping genes,HKGs)通常以恒定且不受胁迫影响的方式表达,是RT-qPCR内参基因的适宜选择对象[5]。将目标基因的表达数据相对于管家基因(内参基因)进行归一化,可以确定目标基因的表达水平是上调还是下调。
尽管内参基因的表达水平被认为是稳定的,但实际上在不同条件下仍会发生变化[7]。……
