覃昱茗 张宇 黄国弟 莫永龙 罗世杏 荣涛

摘 要：采用正交设计方法，对影响PCR反应体系的5个因素（Mg2+、Taq DNA聚合酶、dNTPs、引物和模板DNA）进行了优化，建立了适用于杧果的SC-SSR-PCR反应体系。结果表明，总反应体系25 μL中，包含模板DNA用量100 ng·mL-1、Mg2+浓度2.00 mmol·L-1、引物浓度0.40 μmol·L-1、Taq DNA 聚合酶浓度1.00 U、dNTPs浓度0.15 mmol·L-1。利用优化的杧果SC-SSR-PCR反应体系对10对SC-SSR引物进行验证，均能扩增出清晰、明亮、特异的电泳条带。因此，优化的杧果SC-SSR-PCR反应体系适用于杧果种质鉴定和亲缘关系分析。

关键词：杧果 SC-SSR 正交设计 体系优化

中图分类号：S667.7           文献标识码：A

杧果（Mangifera indica L.）为漆树科重要常绿经济果树，原产印度，其果实风味极佳[1]。国内海南、广东、广西、福建、云南、贵州、四川均有栽培[2-3]。起始密码子-微卫星扩增多态性（start codon simple sequence repeat，SC-SSR）标记是郭大龙等结合SCoT和ISSR分子标记技术开发出来的一种既能将标记位点与表达序列紧密联系，又具有相对较高多态性的新型分子标记[4]。目前，SC-SSR标记已应用于猕猴桃遗传多态性分析及其指纹图谱构建，但在其他物种中的应用研究在国内并不多[5]。

由于杧果高度异花授粉，种子高度杂合，且生产交易中往往存在同物异名和异物同名等问题，给杧果育种工作带来了诸多阻碍[6-8]。SC-SSR分子标记在种质鉴定方面具有独特的优势，但在杧果中尚未有报道。基于这些问题，本研究较全面地建立并优化杧果的SC-SSR反应体系，为其在杧果种质资源评价、遗传多样性分析等领域的应用提供技术参考。

1 材料与方法

1.1 材料与仪器

5份杧果材料（表1）采集自广西大学农学院果树种质资源圃。……