基于流式细胞仪和高通量测序技术联用的超微藻检测方法
2021-08-17何义亮
净水技术 2021年8期
关键词:方法
宁 曼,徐 峥,何义亮
(上海交通大学中英国际低碳学院,上海 200240)
超微藻是水体中藻种群结构的重要组成部分,由于其独特的生长特性和丰富的物种组成,近年来受到国内外学者的广泛关注,成为水体中微生物构成的研究热点。超微藻在数量上虽不如传统的非超微藻[1],但其对水体初级生产力和群落结构多样性及稳定性等方面贡献巨大,深入了解超微藻的动态变化规律有利于更好的评估水体水质质量。
目前的研究中,对超微藻进行检测的手段很少,且具有局限性。光学显微镜受到放大倍数和分辨率的限制[2],无法满足细胞计数和种群识别的要求,具有耗时长、人为误差明显的缺点。而荧光显微镜对自发荧光较弱且混合生长的藻群辨认准确率低,不能反映藻细胞的生理状况。平板计数法耗时长,操作过程中对无菌环境条件要求极严格,且因超微藻大部分种属不能直接进行分离纯培养而无法运用[3]。
针对以上难点,流式细胞仪和高通量测序技术的运用为超微藻总量测定和种群识别提供了新方向。流式细胞仪能对超微藻进行计数和荧光检测,得到藻细胞数量,根据色素含量及与纯培养藻细胞位置的对照完成藻群识别,但一般只能精确到门级别,需要分子生物学手段的辅助从而获得更加准确的种属信息。高通量测序技术作为分子生物学技术的一个重要分支[4],明确不同微生物的注释信息和相对丰度变化信息,有助于对微生物多样性及其分布模式进行更深入的探究,但针对超微蓝藻和超微真核藻的高通量测序方法还有待进一步研究和优化。……
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