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基于深度学习的作物基因组学和遗传改良

2021-08-05辛志奇赵航汪海路铁刚

生物技术进展 2021年4期
关键词:深度人工智能模型

辛志奇, 赵航, 汪海, 路铁刚*

1.中国农业科学院生物技术研究所,北京100081;2.中国农业大学国家玉米改良中心,北京100193

随着全球人口数量不断增加,到2050 年,全球对粮食的需求预计将比2005 年增加100%~110%[1-2]。为满足人们对农作物产品日益增长的需求,创新育种技术显得尤为重要。在漫长的农业历史中,育种主要经历了三个阶段:通过观察植株表型,选育优良自交系的传统育种;应用统计学、数量遗传学预先设计杂交育种实验,获得杂种优势的杂交育种;综合单倍体育种、分子标记育种和转基因育种的现代生物工程育种[1]。Edward S Buckler[2]总结了过去的三个时代,并提出了“育种4.0”的概念。王向峰等[1]提出了在“育种4.0”时代深度融合生命科学、信息科学和育种科学的理念。人工智能设计育种是由人工智能与育种相结合,能够给传统育种带来革命性的改变。它包括利用深度学习和机器学习把基因组学、转录组学、蛋白质组学、表观遗传学、代谢组学和表型组学的多组学数据结合,构建遗传调控网络,实现对作物表型的精准预测;深度学习指导基因编辑,实现对作物表型的控制和设计;深度学习在合成生物学的应用会使作物的设计育种更加自由高效。

1 人工智能及分支

人工智能这一概念最早在20 世纪40 年代被提出,但是受计算能力的限制,人工智能领域一直处于发展的低谷。进入21 世纪后,计算机性能的大幅提升(尤其是GPU 的发展)使得人工智能领域重新回到人们的视野。目前,人工智能已被应用于多个领域。……

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