基于转录组测序筛选影响从江香猪产仔数的候选基因
2021-08-03张福平唐靓婷王嘉福冉雪琴李升黄世会
南方农业学报 2021年4期
张福平 唐靓婷 王嘉福 冉雪琴 李升 黄世会



張福平(1978-),博士,副教授,贵州省生态家禽产业发展专班副班长,贵州省畜牧兽医学会家禽学分会理事长,贵州省畜禽遗传资源委员会委员,主要从事地方家禽遗传资源保护与开发利用研究工作。先后主持贵州省科技计划项目“贵州黄鸡种质资源创新利用研究”“优质赤水乌骨鸡培育及高效养殖HACCP体系研究”“黔东南小香鸡配套系选育及示范推广”“高产绿壳蛋鸡配套系选育及推广”等科研项目20余项;主要参与国家科技支撑计划项目1项、国家自然科学基金项目2项。获贵州省科学技术进步奖三等奖1项;制定地方标准3项;主编《蛋鸡养殖100问》养殖技术丛书1册;在《Theriogenology》《南方农业学报》《中国畜牧兽医》等科技期刊上发表学术论文60余篇。
摘要:【目的】筛选出影响从江香猪产仔性状的基因调控网络,揭示其繁殖分子机理,为后期开展从江香猪繁殖性能研究及良种选育提供理论依据。【方法】以高产仔家系(平均产仔数≥12头,遗传稳定)和低产仔家系(平均产仔数8~10头,遗传稳定)从江香猪为研究对象,选择初情期不同产仔家系从江香猪卵巢组织各3个,使用Illumina HiSeqTM 2000测序仪进行转录组测序(RNA-Seq),并对筛选获得的差异表达基因进行GO功能富集分析及KEGG信号通路富集分析,以寻找与从江香猪产仔数相关的基因调控网络。【结果】从高产仔家系和低产仔家系从江香猪卵巢组织中测序获得的纯净序列(Clean reads)均超过5000万条,且有96.00%以上的Clean reads能比对上猪参考基因组。……
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