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不同类型呼吸道上皮细胞感染金黄色葡萄球菌的基因表达差异研究

2021-07-31尹僖,谢伟

现代医药卫生 2021年14期
关键词:差异分析

尹 僖,谢 伟

(重庆医科大学附属儿童医院核医学科/儿童发育疾病研究教育部重点实验室/儿科学重庆市重点实验室/重庆市儿童发育重大疾病诊治与预防国际科技合作基地,重庆 400014)

感染性疾病是全球引起人类死亡的第二大主要原因,而金黄色葡萄球菌是引起人类感染[1],尤其是呼吸道感染的主要病原体之一[2-3]。金黄色葡萄球菌是一种可寄生于宿主体表的条件致病菌,同时也是引起局部化脓性感染、肺炎、心内膜炎及全身脓毒血症等医院获得性感染的主要致病菌[4]。α溶血毒素(Hla)是一种外毒素,通常由致病性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌产生[5]。Hla可促使中性粒细胞裂解,损伤上皮细胞而产生生物学效应,引起菌血症等临床症状[6]。呼吸道上皮作为宿主对抗细菌感染的第一道防线,研究其在感染条件下发生的变化对于理解宿主-细胞的相互作用非常关键。人支气管上皮细胞株16HBE14o-是一种对Hla敏感的细胞株,而人支气管上皮细胞株S9则对Hla不敏感[7]。对比研究这2种细胞株,对研究Hla在金黄色葡萄球菌感染时对呼吸道上皮细胞的作用具有重要意义。

表达谱芯片可以同时研究组织的数万个基因表达情况,在全基因组层面对细胞的基因表达变化进行全面化较,寻找与感染相关的各种基因。美国国立卫生研究院生物信息中的基因芯片数据库(GEO)是当今最大、最全面的公共基因表达谱数据库,至今已经收集100多万个样本的表达谱原始数据。从不同的角度对数据进行再分析,可以让这些数据获得更大的使用价值,也可减少不必要的重复研究[8-9]。……

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