何卓琳，唐敏嘉，张雪婧，侯 晓，蒲万霞

(中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 农业农村部兽用药物创制重点实验室甘肃省新兽药工程重点实验室，兰州 730050)

大肠杆菌(Escherichiacoli,E.coli)在环境和动物体内外广泛存在，可通过饮水、食物以及密切接触等途径传播[1]。粪便是E.coli的“储存库”[2]，可向外界散播病原菌，污染饮水、饲草、农作物[3]，也可改变黏膜屏障破坏体内菌群平衡或感染局部组织[4]，最终危害人类和动物健康。养殖场通常添加干燥土壤和秸秆维持运动场的干燥和洁净，同时也为微生物提供了繁殖场所，对动物健康存在潜在危险。粪便作为有机肥料，用于农作物生产[5]，可增加动植物间的传播和食物链污染的风险[6]。

目前动物感染和动物产品污染致病性E.coli在动物健康和公共卫生安全上是一个严重的问题。2019年4月在美国10个州暴发的牛肉污染E.coliO103事件强调了流行病学调查和寻找简便高效的微生物溯源技术及分型方法的重要性[7]。因此，准确、快速地比较菌株间亲缘关系和精细分型，对流行病学调查、控制和预防具有重要意义。本试验选择奶牛养殖环境分离E.coli进行亲缘关系和系统进化分群分析，以期为健康养殖提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 样品来源

2017—2019年，在新疆某大型奶牛场(养殖规模2.5万头)相对固定位置采集样品209份，见表1。粪(土)样用五点混合采样法采集，在运动场或粪池四周的中点及中心采样(粪土五个点的样同样由五点采样法所得)，每点均采500 g或500 mL左右，装入自封袋或灭菌瓶，同一运动场或粪池的样混匀为1份。……