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基于重测序的民猪与大白猪SLAⅠ类基因多态性及抗病潜能差异分析

2021-07-26李婧娜吴俊超王立刚王立贤

畜牧兽医学报 2021年7期

李婧娜,疏 泽,吴俊超,程 锋,王立刚,王立贤

(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193)

养猪业在我国畜牧业,甚至整个国民经济中都占着举足轻重的地位。经过长期发展,我国养猪业规模化程度越来越高,但是随着饲养密度增大,猪群的健康开始恶化,严重限制了生产效率,降低了猪场收益[1]。研究发现,中外猪种对疾病的抗性以及敏感性不同[2-3]。因此,通过对我国地方猪抗病机理的研究,可以提高猪的免疫能力、生活力及生产力[1]。

动物的免疫识别、对疾病的抵抗能力以及免疫系统的调节一定程度上依赖于主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC,在猪中称为猪白细胞抗原(swine leukocyte antigen,SLA))[4-5]。SLA对感染疾病后的免疫反应以及对病毒的识别和清除具有很重要的作用[6-7]。SLA基因位于猪7号染色体着丝粒两端,分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类[8-9],具有高度多态性、单倍型遗传、连锁不平衡等特征[10]。SLAⅠ类基因主要分为3类:Ⅰa、Ⅰb和Ⅰc。Ⅰa包括SLA-1、SLA-2、SLA-3、SLA-4、SLA-5、SLA-9、SLA-11;Ⅰb包括SLA-6、SLA-7、SLA-8;Ⅰc包括MIC1和MIC2[11]。Ⅰa类基因中只有SLA-1、SLA-2、SLA-3具有完整的Ⅰ类基因结构,可编码SLAⅠ类分子。经典SLAⅠ类基因包含8个 外显子,其中前导多肽链是由外显子1编码,α1-3功能区域分别由外显子2~4编码,跨膜区由外显子5编码,胞质区由外显子6~8编码。SLAⅠ类分子由重链和轻链(β2 m)组成,重链分为3个区,为胞浆区、跨膜区、胞外区。胞外区包含α1、α2和α3三个结构域,多态性主要集中在α1、α2[12]。α1、α2形成抗原肽结合槽,α1和α2功能区的α螺旋结构为该槽的两侧壁,底部为与α螺旋呈直角排列的8条反平行β片层链。肽结合槽底部有6个不同的口袋,决定了T淋巴细胞表位结合的特异性,不同的等位基因与不同类型的T细胞表位结合是由锚定残基和氨基酸共同决定的[13]。……

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