苦蘵中睡茄交酯类成分的抗炎靶标预测
2021-07-23薛云馨宗明月
薛云馨 刘 灿 宗明月 赵 烽
烟台大学药学院新型制剂与生物技术药物研究山东省高校协同创新中心、分子药理和药物评价教育部重点实验室 山东 烟台 264005
苦蘵(Physalis angulata L.)是茄科酸浆属草本植物,大多分布于美洲热带地区,在我国分布较少,主要集中于我国东部至西南部[1-2]。从苦蘵中分离鉴定的化合物已有很多,主要有:睡茄交酯类、黄酮类、萜类、生物碱类等[3-4],在众多的成分中,睡茄交酯类是苦蘵的主要活性成分。睡茄交酯是具有28个碳原子的一类麦角甾烷类化合物,其C-19与C-23形成一个δ内酯环的侧链[5]。根据其结构骨架的不同,主要分为醉茄内酯类和酸浆苦素类,代表性化合物主要有醉茄内酯 A(physagulin A)、醉茄内酯 B(physagulin B)、酸浆苦素A(physalin A)、酸浆苦素B(physalin B)等。课题组前期对苦蘵的乙醇提取物进行系统的化学成分研究,已分离鉴定了一些单体化合物,本文选取9个代表性的化合物,其中4个为醉茄内酯类,5个为酸浆苦素类[6],运用分子对接的方法,对睡茄交酯类成分的抗炎作用靶标进行预测,并结合活性验证阐明其作用机制。
1 材料与方法
1.1 程序系统 所有研究及计算工作均在Chem Bio Office 2016中的ChemBioDraw模块、SYBYL-X2.0中的Surflex-dock模块以及PyMOL中完成。
1.2 靶点准备 本研究的靶点均从Protein Data Bank(PDB)数据库中获取,根据文献[7-8],选取了环氧合酶-2(COX-2)、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、细胞外调节激酶(ERK)、p38、应激活化蛋白激酶(JNK)、NF-κB作为炎症相关信号传导网络的关键靶点进行研究,这些靶点是当前抗炎药物设计的重要靶标,研究比较充分,因此被列为候选靶点。在RCSB蛋白数据库(http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)搜索以上靶点对应蛋白,得到PDB编号,结果见表1。……
