祁慧鹓，郑晓璇，孙明明，王金锋，马迎飞，朱 冬，王风贺，蒋 新，叶 茂†

（1. 中国科学院南京土壤研究所，土壤环境与污染修复重点实验室，南京 210008；2. 中国科学院大学，北京 100049；3. 南京农业大学资源与环境科学学院，土壤生态学实验室，南京 210095；4. 中国科学院北京生命科学研究院，北京 100101；5. 中国科学院深圳先进技术研究院，深圳 518055；6. 中国科学院生态环境研究中心，北京 100085；7. 南京师范大学环境学院，南京 210023）

病毒是地球上数量最多的生命体，广泛存在于地球各种环境中[1]。土壤病毒在调控微生物群落组成、影响元素循环利用、促进生物进化等方面发挥重要作用[2-4]。近年来，海洋环境中病毒生态学研究进展迅速，虽然学术界逐渐意识到病毒在土壤环境中发挥着重要作用，但由于病毒缺少通用的标记基因，以及受到土壤异质性、多样性的限制，陆地系统，特别是土壤环境中病毒研究进展相对缓慢[5-6]，土壤病毒学研究远落后于海洋等水体环境[2]。噬菌体是寄生在细菌、古菌等原核生物里的病毒，也是土壤中最主要的病毒类群。单株噬菌体的全基因组测序有助于了解噬菌体的基因组结构及功能特征；而随着测序技术的发展，宏病毒组学研究日益受到关注，它摆脱了以往微生物分离纯培养的限制，以环境样品为研究对象，直接从土壤样品中富集和提取病毒基因组后进行测序和生物信息学分析[7-8]，为土壤病毒研究提供了新的技术手段[9]。

由此，本文主要介绍了土壤研究方法及病毒组研究进展，指出了土壤病毒研究当前面临的困境，并对未来的研究方向和发展趋势进行了展望，以期为后续土壤宏病毒研究提供科学参考。……