基于线粒体DNA控制区序列的重庆岩原鲤人工养殖群体遗传多样性分析
2021-07-17岳华梅李创举
岳华梅 阮 瑞 曹 宏 周 莉 蒋 伟 李 双 李创举
(1. 中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业部淡水生物多样性保护重点实验室, 武汉 430223; 2. 中国科学院水生生物研究所, 武汉 430072; 3. 重庆市水产科学研究所, 重庆 400020)
岩原鲤(Procypris rabaudi), 隶属鲤形目, 鲤科,鲤亚科, 原鲤属, 是我国特有的重要经济鱼类。其主要分布于长江上游干流、支流及金沙江中上游,是一种栖居于岩石缝间的底层鱼, 以四川境内嘉陵江和岷江分布较多[1]。岩原鲤成鱼为杂食偏肉食性鱼类, 主要摄食底栖动物, 如淡水壳菜、蚬、小螺等软体动物和摇蚊幼虫、蜉蝣目和毛翅目幼虫等[2]。由于过度捕捞、环境污染及长江上游大型水坝建立对其栖息环境的破坏, 岩原鲤野生资源锐减, 濒临灭绝, 现已被列入《中国濒危动物红皮书》[3,4]。目前其资源养护手段主要为人工繁殖个体增殖放流。然而, 在岩原鲤人工繁殖过程中, 繁育场面临着有效繁殖群体过小、近亲交配和逆向选择等问题。因此在进行岩原鲤人工育种时有必要对后备亲鱼的遗传背景进行分析, 以抑制养殖群体的种质退化和防止因近交衰退而造成后代成活率降低和生长速度减慢等。
线粒体DNA(mtDNA)呈母系遗传, 具有较高的突变性, 突变固定后形成的多态性位点反映出群体遗传特性、种群分化和种属关系等特点[5,6]。线粒体控制区(Control region, 又称D-loop)是线粒体上的一段非编码区, 位于mtDNA的tRNA-Pro 和tRNAPhe之间, 因缺乏编码选择压力而比其他线粒体基因的进化速率更快, 其碱基替换率比mtDNA的其他区域高5—10倍, 是线粒体基因组中最具多态性的片段, 已成为探讨种群内部遗传多样性和分子系统地理学的良好材料[7—9]。……
