周忆莲，崔垚鑫，刘俊华，刘燕霏，杨建德

粪肠球菌遗传演化关系分析

周忆莲，崔垚鑫，刘俊华，刘燕霏通信作者，杨建德通信作者

（天津农学院 动物科学与动物医学学院 天津市农业动物繁殖与健康养殖重点实验室，天津 300392）

为探究不同国家、地区、宿主的粪肠球菌的遗传演化规律，明确不同地区粪肠球菌的同源程度和亲缘关系，试验采用生物信息学方法，对NCBI核苷酸数据库里粪肠球菌的16S rRNA基因进行筛选整理、剪裁对齐后与本试验分离菌株构建粪肠球菌的基因进化树，进行比较分析。结果表明：粪肠球菌在进化过程中跨地域稳定遗传，起源地可能是德国，与其他国家都有很高的亲缘性；而且数据显示进化缓慢，发生变异的几率很低，为大范围预测粪肠球菌感染发生及分子流行病学调查提供依据。

粪肠球菌；同源性比较；基因进化树；遗传演化；亲缘关系

粪肠球菌（，Ef）也称粪链球菌，广泛分布在畜禽养殖场和畜禽产品生产加工的环境中，也存在于人和动物体的肠道[1]。在正常情况下，Ef属于肠道有益菌，但Ef因特殊原因大量繁殖会造成动物体内不同器官感染，如生殖系统、泌尿道、心内膜炎、败血症和脑膜炎[1-4]。有报道称Ef耐药性有增强趋势[5]，多种抗生素都无法杀灭 Ef，例如链霉素、喹诺酮类、庆大霉素和头孢菌素类药物，给动物Ef感染的治疗带来严峻挑战[6]。

rRNA是细菌系统分类学研究中最常用的方式。细菌rRNA素有“化石”之称，分布在所有生物中，含量约占RNA的80%，具有高度保守性和特异性[4]。……