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新型肿瘤靶标环状RNA的研究进展

2021-07-12方梦蝶张衍梅

中国医学科学院学报 2021年3期
关键词:数据库研究

徐 昊,方梦蝶,李 超,刘 宸,任 娟,张衍梅

浙江省医学科学院杭州医学院分子医学中心,杭州 310013

环状RNA(circular RNA,circRNA)是共价连续的闭合环状体,不具有5’和3’端,这使其结构比线性RNA更加稳定,不易被核酸外切酶降解[1]。起初circRNA被认为是错误剪接的产物[2],或从内含子的套索结构中逃逸的中间产物。随着转录组测序技术(RNA-seq)的广泛应用,众多研究发现circRNA是一类内生的、数量众多的、稳定存在于哺乳动物细胞中的分子,具有一定的组织、时序和疾病特性[3],不再被认为是一类在人体中无作用的RNA分子[4]。circRNA存在于哺乳动物细胞中,正常人体中有超过400种circRNA,其表达异常可诱导肿瘤发生[5-6]。circRNA具有miRNA海绵功能,富含miRNA结合位点,可以解除miRNA对靶基因的抑制作用,进而升高靶基因表达水平,在转录水平上对靶基因进行调控,被称为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)机制[7]。例如乳腺癌中的hsa_circ_0072309(circBase数据库中的ID号)通过miRNA海绵功能调控miR-492,影响乳腺癌发生[8]。circRNA因其特性和生物学功能被认为是一种新型潜在肿瘤标志物,Zeng等[9]研究发现,circRNA作为结直肠癌潜在肿瘤标志物具有较高的诊断价值,circHIPK3是结直肠癌诊断和预后的潜在肿瘤靶标。本文总结了近年来circRNA在癌症中的研究进展,包括circRNA的发生机制、功能、数据库内容和研究方法,以及在肿瘤中的应用研究。

circRNA发生机制

Sanger等[2]于1976年发现了一些单链共价闭合的植物病毒,为circRNA研究奠定了基础,此后越来越多的circRNA逐渐被人们发现[10-12]。1个基因可以产生多种不同的circRNA,甚至有些circRNA的表达量高于其对应的母基因线性RNA。大多数circRNA是由外显子形成的,也有少数是以内含子或外显子-内含子的形式成环的,成环的机制主要是反向剪接[13]。……

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